当前解析结果
SmilChr01G000436| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000436 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000436 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000436 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 8753789 - 8754928 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131015351 |
|---|---|
| GeneID | 131015351 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015351 |
| 原始查询 | SmilChr01G000436 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13650 (Asp_protease_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015351 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057799745.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057799745.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057799745.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799745.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057799745.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057799745.1PF13650
Asp_protease_2 158-252 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057799745.1 |
Pfam | PF13650 |
Asp_protease_2 | Domain | 158 | 252 | 1.8e-06 | 29.3 | Aspartyl protease |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。