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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000451`

染色体: Chr01 坐标: 9189006-9190472 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000451`
名称	SmilChr01G000451
描述	uncharacterized SmilChr01G000451
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9189006 - 9190472 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015770`
GeneID	`131015770`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015770`
原始查询	`SmilChr01G000451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0656500` - identity=26; qcov=0.393; evalue=9.38e-10; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015770

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057800206.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057800206.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800206.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800206.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800206.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9189025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B12
`Chr1:9189034`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A15,A2,A3,A5,B100,B102,B103,B105,B11,B124,B127,B129,B134,B139,B140,B15,B21,B23,B27,B30,B33,B48,B58,B6,B62,B65,B70,B74,B77,B80,B81,B88,B90,B96,C11,C14,C16,C18,C3,C36,C4,C45,C5,C58,C6,C60,C61,C62,C68,C7,C70,C71,C75,C77,C80
`Chr1:9189037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr1:9189056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B74,C70
`Chr1:9189059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:9189065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr1:9189074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	97	A16,A18,A22,A23,A25,A4,A7,B1,B109,B112,B115,B117,B12,B125,B126,B129,B136,B14,B140,B16,B17,B18,B2,B23,B25,B34,B35,B38,B40,B41,B44,B46,B48,B49,B5,B50,B52,B56,B57,B58,B59,B60,B62,B65,B66,B72,B74,B76,B77,B78,B80,B83,B85,B87,B89,B90,B96,C16,C2,C22,C23,C24,C27,C28,C29,C30,C32,C33,C44,C46,C47,C48,C52,C54,C55,C56,C60,C65,C68,C69,C7,C70,C73,C74,C78,C8,C80,C81,C83,C85,C9,D1,D10,D2,D4,D6,D8
`Chr1:9189082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:9189086`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A15,A16,A2,A5,B10,B100,B102,B103,B105,B113,B115,B118,B124,B134,B136,B139,B140,B21,B27,B30,B33,B48,B6,B60,B64,B65,B70,B77,B88,B90,B96,C11,C14,C18,C3,C36,C44,C45,C47,C5,C58,C61,C62,C63,C68,C70,C71,C75,C77,C80
`Chr1:9189118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B135,C35
`Chr1:9189121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B118,B34,B69,B75,C20,C82
`Chr1:9189122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800206.1

488 aa

244

488

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 71-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800206.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	71	216	5.6e-24	85.5	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944223.1
ATGGATTTGTCAAGTGTGTCGGCTCGGCCTCCTACTCTTGATAGTAGTGGCAAGAACTACAACTTGTGGAAAACTAGGATGAAAATCTATATCAAATCTATTGATGAACGTGCCTGGGTTGCTGTGTTGGATGGATGGACTCCACCGCGTACCACTGATGATAATGGAGTTACTTCTCTCACACCCGAGAGTAAATGGTCTGCTGATGAAAGACTCATTTCTAACCATAACTCCAGAGCCTTGAATGCTATCTTTATCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015770
ATGGATTTGTCAAGTGTGTCGGCTCGGCCTCCTACTCTTGATAGTAGTGGCAAGAACTACAACTTGTGGAAAACTAGGATGAAAATCTATATCAAATCTATTGATGAACGTGCCTGGGTTGCTGTGTTGGATGGATGGACTCCACCGCGTACCACTGATGATAATGGAGTTACTTCTCTCACACCCGAGAGTAAATGGTCTGCTGATGAAAGACTCATTTCTAACCATAACTCCAGAGCCTTGAATGCTATCTTTATCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800206.1
MDLSSVSARPPTLDSSGKNYNLWKTRMKIYIKSIDERAWVAVLDGWTPPRTTDDNGVTSLTPESKWSADERLISNHNSRALNAIFIYVDVPAFRMISNCTEARDAWLILQEQCEGSASVRATKMRMLTTKFEILRMRDDETISAYYEKLCEISNEAVGLGEPISNERLVSKILRSLPERYNMKISSIEETTDVATMRVGDLVSKLLTFEMNLEQQKADHVSKSVAFRVEKIPENSEITNMSECTDVDPEEEDDVNLAMLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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