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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000455`

染色体: Chr01 坐标: 9247288-9255674 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000455`
名称	SmilChr01G000455
描述	uncharacterized SmilChr01G000455
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9247288 - 9255674 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015913`
GeneID	`131015913`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015913`
原始查询	`SmilChr01G000455`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G28780` (AT5G28780) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993] identity=37.8; qcov=0.355; evalue=6.58e-33; confidence=low
Rice	`Os04g0357300` - identity=29.8; qcov=0.832; evalue=6.5e-40; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015913

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800410.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800410.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800410.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800410.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9247296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B78
`Chr1:9247296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:9247301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:9247312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:9247318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B134,B138,B47,C23
`Chr1:9247330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C23
`Chr1:9247351`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B20,B28,B36,B57,B71,B94,C13,C30,C6,C7,C77
`Chr1:9247370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B67,C36
`Chr1:9247373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:9247395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B36,B67,C5,C82
`Chr1:9247403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B120,B6,C71,D3
`Chr1:9247404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800410.1

529 aa

264

529

PIF1

Pif1_2B_dom

PF05970 PIF1 236-318 aa PF21530 Pif1_2B_dom 445-491 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800410.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	236	318	2.3e-29	103.3	PIF1-like helicase
`XP_057800410.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	445	491	2.6e-19	69.4	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944427.1
ATGGAGTCTCAGGCTGCCACTATATTCAAGAAATTGGGTGCGGCAGTCAACTTGATGCCGTTTGATATATTCAAGAAATTGGGTAGGAAGGAAGAGGAGCTTAAATGCACGAATACTAGACTTCAGCTAGCTGACGGAGCAATTAGCAGCACGCGTGGACTTTTAGAAGATATCGAGGTCACAGTGAGAGGAATCACGGTGCTAGCAGATTTTGTGGTGCTTGAAGCAGGGCAAGCTCTAACGAGCCCAGCACTGAATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015913
ATGGAGTCTCAGGCTGCCACTATATTCAAGAAATTGGGTGCGGCAGTCAACTTGATGCCGTTTGATATATTCAAGAAATTGGGTAGGAAGGAAGAGGAGCTTAAATGCACGAATACTAGACTTCAGCTAGCTGACGGAGCAATTAGCAGCACGCGTGGACTTTTAGAAGATATCGAGGTCACAGTGAGAGGAATCACGGTGCTAGCAGATTTTGTGGTGCTTGAAGCAGGGCAAGCTCTAACGAGCCCAGCACTGAATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800410.1
MESQAATIFKKLGAAVNLMPFDIFKKLGRKEEELKCTNTRLQLADGAISSTRGLLEDIEVTVRGITVLADFVVLEAGQALTSPALNSAPALNSICQDFAEANLMSTRPEEDEIIQDFLDNLQDDEAIEDEFLAKLPLNVNAVKELPTTLKEETEVEEERADVLKGKEEIVQRVQILLINFPTMPLPNETVISSTVNLLILEETSYNIEEINAEHHKLYHSLTDEQNIVYEKIMTAVDSGRTAHSRFGIPLDCDENSTCHK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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