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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000460`

染色体: Chr01 坐标: 9423489-9425648 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000460`
名称	SmilChr01G000460
描述	uncharacterized SmilChr01G000460
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9423489 - 9425648 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016283`
GeneID	`131016283`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016283`
原始查询	`SmilChr01G000460`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=30; qcov=0.302; evalue=7.55e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016283

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800956.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057800956.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057800956.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800956.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800956.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9423529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C39
`Chr1:9423539`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A13,A16,A22,A4,B1,B105,B112,B117,B130,B140,B16,B18,B2,B32,B36,B40,B46,B48,B5,B52,B60,B90,B92,B93,C11,C2,C24,C27,C32,C34,C47,C48,C55,C68,C69,C83,D2,D4,D6
`Chr1:9423582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C78
`Chr1:9423599`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B67,C78
`Chr1:9423599`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B67,C78
`Chr1:9423616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C78
`Chr1:9423621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C78
`Chr1:9423667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B78,C80,C87
`Chr1:9423668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:9423674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:9423683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B37,B88,D3
`Chr1:9423710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800956.1

662 aa

331

662

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 211-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800956.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	211	285	2e-09	38.4	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944973.1
ATGTCGGACATCGATGACATCCCTCTCACACCTAATGGAACTAAGATCAGCCCAGATGATCCAACATCTTCGGTAAGAAACATTAGAGCTGAGGTAATTTGTGCTAACACGGGTAATCTTCATGTGAATGCAGGTGAAACACACGTCCTGGACCAGACACTCGGAACGATTAAGACAATCGGGATGATCGGGACGATCGGGACAACCATAATGGAAACCCCTATTCTAGGCAACCCGACGTTATGGGACGCAAGTCGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016283
ATGTCGGACATCGATGACATCCCTCTCACACCTAATGGAACTAAGATCAGCCCAGATGATCCAACATCTTCGGTAAGAAACATTAGAGCTGAGGTAATTTGTGCTAACACGGGTAATCTTCATGTGAATGCAGGTGAAACACACGTCCTGGACCAGACACTCGGAACGATTAAGACAATCGGGATGATCGGGACGATCGGGACAACCATAATGGAAACCCCTATTCTAGGCAACCCGACGTTATGGGACGCAAGTCGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800956.1
MSDIDDIPLTPNGTKISPDDPTSSVRNIRAEVICANTGNLHVNAGETHVLDQTLGTIKTIGMIGTIGTTIMETPILGNPTLWDASRSILIGRTNFAQAQVIPAGKLEGDHICNTLTCQPDGVLRQTIPIGQNSNAQDQLLHANLSKQGMTSTHPNMDPSLTRRLADMEKPSSNETRESRPRSRKSAESCYADSPFVDEIALVEMHRKFNFPHMKMFDGASDPDDHIAQYRQRMFTVTIPRDMREACMCTGFGSSLVGPAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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