当前解析结果
SmilChr01G000463| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000463 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000463 |
| 描述 | cytochrome P450 714C2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 9475636 - 9478043 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006529 |
|---|---|
| GeneID | 131006529 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006529 |
| 原始查询 | SmilChr01G000463 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome P450 714C2-like |
| 产物 | cytochrome P450 714C2-like |
| Arabidopsis | AT5G24910 (CYP714A1)cytochrome P450, family 714, subfamily A, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832560] identity=45.5; qcov=1; evalue=3.09e-169; confidence=high |
| Rice | Os12g0119000 (CYP714C2)- identity=50.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006529 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057789664.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057789664.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789664.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789664.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789664.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:9475815 |
ATC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B34,B71,D5 |
Chr1:9475815 |
ATC |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B34,B71,D5 |
Chr1:9475854 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B85 |
Chr1:9475864 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:9476029 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,C19,D10,D11 |
Chr1:9476166 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C50 |
Chr1:9477668 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr1:9477689 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057789664.1PF00067
p450 89-490 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057789664.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 89 | 490 | 4.1e-77 | 260.6 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。