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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000465`

染色体: Chr01 坐标: 9535757-9539133 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000465`
名称	SmilChr01G000465
描述	uncharacterized SmilChr01G000465
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9535757 - 9539133 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016514`
GeneID	`131016514`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016514`
原始查询	`SmilChr01G000465`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=29.7; qcov=0.517; evalue=1.77e-32; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=26.8; qcov=0.74; evalue=8.26e-39; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016514

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801234.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057801234.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801234.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801234.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9535765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B126,C11
`Chr1:9535918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr1:9535963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr1:9535966`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A16,A22,A4,B16,B18,B2,B40,B41,B48,B5,B52,B60,B85,B90,B92,C11,C32,C47,C48,C55,C68,C69,D2,D4,D6
`Chr1:9535979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B38,C31,C73,C82
`Chr1:9535983`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr1:9535983`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr1:9535986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr1:9536030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:9536047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:9536060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A9,B42,B43,B57,B59,C34,C7,C71
`Chr1:9536068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801234.1

515 aa

258

515

RVT_1

PF00078 RVT_1 3-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801234.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	3	154	3.2e-13	50.7	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945251.1
ATGGCGTGCAAAATTGACATTAAGAAGGCTTTTGATACGCTGCGTTGGGATTTCTTGCTCAAACTGCACAAGTATTTTGAGTGCACTCGTGGCATTCGCCAGGGTGATCCTCTGTCTCCCATTTTATTTGGTATCACGGAAGATGTGTTGAGTGCTCTTTTTAAGAACTGCGTGGCGTCGGGGCATCTTGATCCAATGAGGATGAATCGGCAAACTTCGTTTGCGACACACTTACTTTATGCTGATGACATTTTGGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016514
ATGGCGTGCAAAATTGACATTAAGAAGGCTTTTGATACGCTGCGTTGGGATTTCTTGCTCAAACTGCACAAGTATTTTGAGTGCACTCGTGGCATTCGCCAGGGTGATCCTCTGTCTCCCATTTTATTTGGTATCACGGAAGATGTGTTGAGTGCTCTTTTTAAGAACTGCGTGGCGTCGGGGCATCTTGATCCAATGAGGATGAATCGGCAAACTTCGTTTGCGACACACTTACTTTATGCTGATGACATTTTGGTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801234.1
MACKIDIKKAFDTLRWDFLLKLHKYFECTRGIRQGDPLSPILFGITEDVLSALFKNCVASGHLDPMRMNRQTSFATHLLYADDILVFGRATEANARTILHILNFYGSLFGQICSMEKSHIFFGDKVQNSLRRSIKGILKFRRGTLPFVYLGVPIFAGAIKAIYLRAIHDRILLKFARWKGMHLSMAGRICLVKSVIQISITHSMMVYRWPKNLLKELDRKYRNFIWTGDVMKKPNCSVNWDRICAIKEEGGLGLRSFSLM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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