当前解析结果
SmilChr01G000469| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000469 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000469 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000469 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 9586022 - 9587586 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006535 |
|---|---|
| GeneID | 131006535 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006535 |
| 原始查询 | SmilChr01G000469 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006535 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057789672.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057789672.1 |
| 3 | Cell projection | 细胞突起 | 0.20000 | XP_057789672.1 |
| 4 | Cilium | 纤毛 | 0.20000 | XP_057789672.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789672.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:9586828 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B22,C42,C80 |
Chr1:9586849 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,C59,C62 |
Chr1:9586939 |
T |
TCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | C59,C9 |
Chr1:9586939 |
T |
TCA |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | C59,C9 |
Chr1:9586942 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C59,C9 |
Chr1:9586942 |
TGC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | C59,C9 |
Chr1:9586951 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C59,C9 |
Chr1:9586980 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,C4 |
Chr1:9587016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B113,C67 |
Chr1:9587074 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 20 | A1,A10,B105,B112,B119,B130,B16,B20,B52,B59,B67,B7,B73,C13,C16,C23,C4,C50,C56,C59 |
Chr1:9587077 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 16 | A1,A10,B105,B112,B130,B16,B20,B52,B59,B67,B7,B73,C13,C23,C56,C59 |
Chr1:9587082 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 32 | A13,A24,A9,B100,B105,B132,B137,B14,B23,B38,B46,B53,B58,B61,B71,B75,B77,B89,B95,C18,C21,C3,C30,C42,C45,C5,C61,C71,C77,C80,C84,D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。