当前解析结果
SmilChr01G000479| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000479 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000479 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000479 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 9867737 - 9873570 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006533 |
|---|---|
| GeneID | 131006533 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006533 |
| 原始查询 | SmilChr01G000479 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os05g0315200; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os05g0315200; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G01970 (AT5G01970)heat-inducible transcription repressor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830706] identity=50.7; qcov=0.866; evalue=1.18e-103; confidence=high |
| Rice | Os05g0315200- identity=57.9; qcov=0.754; evalue=1.72e-110; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006533 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057789669.1 |
| 2 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.40000 | XP_057789669.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057789669.1 |
| 4 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057789669.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789669.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:9868142 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B109,B27,B65,C16 |
Chr1:9868185 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,B27 |
Chr1:9868187 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 100 | A1,A14,A20,A8,B1,B108,B11,B117,B118,B119,B12,B123,B125,B127,B13,B131,B133,B134,B138,B140,B15,B16,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B34,B35,B37,B38,B4,B42,B43,B44,B45,B47,B5,B50,B57,B58,B61,B64,B65,B66,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B79,B86,B89,B90,B92,B94,B97,B98,B99,C11,C14,C15,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C34,C36,C40,C41,C46,C47,C49,C52,C54,C55,C56,C6,C60,C61,C69,C72,C75,C76,C77,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C87,D11,D8 |
Chr1:9868188 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B99,C64 |
Chr1:9868190 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,C32,C68,C71 |
Chr1:9868207 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B88 |
Chr1:9868250 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B131,B4,B99,C64,C66 |
Chr1:9868252 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B51,B59,C41,C56 |
Chr1:9868260 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B20,C44,C70 |
Chr1:9868264 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr1:9868267 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C26,C31 |
Chr1:9868284 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B139,C32,C37 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。