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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000495`

染色体: Chr01 坐标: 10099754-10101707 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000495`
名称	SmilChr01G000495
描述	60S ribosomal protein L10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	10099754 - 10101707 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006556`
GeneID	`131006556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006556`
原始查询	`SmilChr01G000495`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L10
产物	60S ribosomal protein L10
Arabidopsis	`AT1G26910` (RPL10B) Ribosomal protein L16p/L10e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837036] identity=88.5; qcov=0.995; evalue=2.04e-145; confidence=high
Rice	`Os05g0169100` (SG12) - identity=88.6; qcov=1; evalue=1.07e-145; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00252 (Ribosomal_L16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789684.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057789684.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789684.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789684.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:10100631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:10100684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C30,D6
`Chr1:10100708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C30,D6
`Chr1:10100739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B61,C4
`Chr1:10100761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C30
`Chr1:10100774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:10100967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,C11,C69,C9
`Chr1:10101238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C80
`Chr1:10101256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:10101323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:10101363`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr1:10101363`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789684.1

252 aa

126

252

Ribosomal_L16

PF00252 Ribosomal_L16 12-166 aa

XP_057789685.1

219 aa

110

219

Ribosomal_L16

PF00252 Ribosomal_L16 12-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789684.1`	Pfam	`PF00252`	Ribosomal_L16	Domain	12	166	1.6e-36	125.9	Ribosomal protein L16p/L10e
`XP_057789685.1`	Pfam	`PF00252`	Ribosomal_L16	Domain	12	166	1.1e-36	126.5	Ribosomal protein L16p/L10e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933702.1
ATGTTGAAACATTCAAATATAGCCCAATCTTGTAGTTAGCCCAAAAAGCAAAGTCAGATCCAGGAAGCTTCTGGACTCCGTCTAATTGTGTAGCGGCGCCCCCATTGACATAATCCAATGCGTAAGCCCACAATCTACCATTTCCTATAAATTCAACAATTTCTCATCCTAAATCCTAATTTTCTCATTCTTCATAGGCGGATCAACCACACACAACTCAATGGGAAGAAGGCCTGCAAGGTGTTACCGTCAAATCAAGA...

XM_057933701.1
CTCCGTCTAATTGTGTAGCGGCGCCCCCATTGACATAATCCAATGCGTAAGCCCACAATCTACCATTTCCTATAAATTCAACAATTTCTCATCCTAAATCCTAATTTTCTCATTCTTCATAGGCGGATCAACCACACACAACTCAATGGGAAGAAGGCCTGCAAGGTGTTACCGTCAAATCAAGAACAAGCCATATCCAAAATCGCGGTTCTGCCGTGGTGTTCCTGATCCCAAGATCAGGATCTATGATGTGGGTATGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006556
ATGGGAAGAAGGCCTGCAAGGTGTTACCGTCAAATCAAGAACAAGCCATATCCAAAATCGCGGTTCTGCCGTGGTGTTCCTGATCCCAAGATCAGGATCTATGATGTGGGTATGAAGAGGAAGGGTGTGGATGAATTCCCATTCTGCGTCCACTTGGTCAGTTGGGAGAAGGAAAACGTGTCGAGTGAGGCACTTGAAGCTGCACGTATTGCGTGCAACAAGTACATGACCAAGTTTGCTGGAAAGGATGCTTTCCACTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789684.1
MGRRPARCYRQIKNKPYPKSRFCRGVPDPKIRIYDVGMKRKGVDEFPFCVHLVSWEKENVSSEALEAARIACNKYMTKFAGKDAFHLRVRVHPFHVLRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGVCARVAIGQVLLSVRCKDNNSQHAQEALRRAKFKFPGRQKIIVSRKWGFTKFNRSDYVRWKSENRIQPDGVNAKVCFLKLQLFFYSKMFMIFSLGCLFVDHVLFILGNFCSFWVVMGDWRTVNQEARF

XP_057789685.1
MGRRPARCYRQIKNKPYPKSRFCRGVPDPKIRIYDVGMKRKGVDEFPFCVHLVSWEKENVSSEALEAARIACNKYMTKFAGKDAFHLRVRVHPFHVLRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGVCARVAIGQVLLSVRCKDNNSQHAQEALRRAKFKFPGRQKIIVSRKWGFTKFNRSDYVRWKSENRIQPDGVNAKLLGCHGRLANRQPGSAFLTAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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