当前解析结果
SmilChr01G000524| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000524 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000524 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000524 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 10701579 - 10702581 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006575 |
|---|---|
| GeneID | 131006575 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006575 |
| 原始查询 | SmilChr01G000524 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006575 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057789703.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789703.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789703.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789703.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057789703.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:10701832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B124,B94 |
Chr1:10701832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,B94 |
Chr1:10701837 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,D10 |
Chr1:10701859 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B126,B9,C44 |
Chr1:10701859 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B126,B9,C44 |
Chr1:10701871 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 55 | A1,A13,A14,A20,A4,A7,A8,B101,B112,B115,B121,B122,B126,B127,B13,B130,B137,B14,B15,B17,B2,B21,B25,B4,B46,B47,B49,B50,B64,B72,B76,B78,B81,B84,B89,C10,C16,C19,C20,C22,C23,C27,C29,C33,C37,C47,C52,C59,C73,C80,C81,C82,C87,D1,D5 |
Chr1:10701888 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr1:10701891 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B126,B9,C44 |
Chr1:10701893 |
T |
TAG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B48,C52,C65,D5 |
Chr1:10701893 |
T |
TAG |
2bp_insertion | CDS_variant | 4 | B48,C52,C65,D5 |
Chr1:10701910 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A16,B74,B82,C11,C69,C71,C82,C9 |
Chr1:10701911 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B48,C52,C65 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。