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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000539`

染色体: Chr01 坐标: 11072824-11074457 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000539`
名称	SmilChr01G000539
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	11072824 - 11074457 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019338`
GeneID	`131019338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019338`
原始查询	`SmilChr01G000539`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=31.5; qcov=0.757; evalue=8.66e-60; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=32.3; qcov=0.938; evalue=9.32e-80; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803891.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803891.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803891.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803891.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:11072834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:11072839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A1,A16,A22,B129,B132,B2,B44,B69,B82,C1,C16,C34,C63,C67,D6
`Chr1:11072870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C83
`Chr1:11072947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A13,A23,A7,B105,B109,B119,B126,B66,B69,B75,B78,B9,B95,C12,C14,C17,C41,C44,C57,C60,C70,C83,D7
`Chr1:11073137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B115,B12,C49
`Chr1:11073144`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A6,B115,B12,B39,C49
`Chr1:11073144`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A6,B115,B12,B39,C49
`Chr1:11073147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B118,B138,B139,B44,C44
`Chr1:11073147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B138,B139,B44,C44
`Chr1:11073370`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A21,A3,A5,A6,B102,B103,B104,B105,B113,B114,B12,B120,B137,B138,B24,B28,B31,B33,B38,B39,B49,B5,B57,B59,B63,B71,B83,B89,B97,B99,C29,C3,C39,C4,C57,C6,C64,C66,C84,C85,D1,D10,D2,D9
`Chr1:11073372`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	44	A21,A3,A5,A6,B102,B103,B104,B105,B113,B114,B12,B120,B137,B138,B24,B28,B31,B33,B38,B39,B49,B5,B57,B59,B63,B71,B83,B89,B97,B99,C29,C3,C39,C4,C57,C6,C64,C66,C84,C85,D1,D10,D2,D9
`Chr1:11073389`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A21,A4,B100,B103,B109,B114,B115,B12,B120,B28,B31,B33,B39,B57,B97,C29,C3,C39,C6,C63,C80,C85,D2,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803891.1

465 aa

232

465

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 216-306 aa PF10551 MULE 237-331 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803891.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	216	306	2.7e-07	31.3	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057803891.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	237	331	2e-29	102.6	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947908.1
ATGGTAGCCCGGATGCGAGGCAGCATACTGATTCCGGAAATAGCAGCAATGGGAATGGTACCTCTCGTGATATTGACAATAGTGTTGAGAGTGATTCTGTACATGAAGTTCGTTCGGACAGTACAGAATTTGGGAATGGTTGTTAGGCGGATCAAGATTTTAATAGCTAAGCGGCTTGAAGTCGGTAGTCTTGTTGACACCTTAGATGATGTCTTTGATTTATACACCGAGTATGGTCGATTTAATGGTTTTTCAGTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019338
ATGGTAGCCCGGATGCGAGGCAGCATACTGATTCCGGAAATAGCAGCAATGGGAATGGTACCTCTCGTGATATTGACAATAGTGTTGAGAGTGATTCTGTACATGAAGTTCGTTCGGACAGTACAGAATTTGGGAATGGTTGTTAGGCGGATCAAGATTTTAATAGCTAAGCGGCTTGAAGTCGGTAGTCTTGTTGACACCTTAGATGATGTCTTTGATTTATACACCGAGTATGGTCGATTTAATGGTTTTTCAGTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803891.1
MVARMRGSILIPEIAAMGMVPLVILTIVLRVILYMKFVRTVQNLGMVVRRIKILIAKRLEVGSLVDTLDDVFDLYTEYGRFNGFSVRKGTQRPDEDAPWKVRTFAKKHNHELLKHSESYLLRSARKMSDGKKRLIVGMKSSGIGVSKAFRFMENEAGGRQNVGFTRNDVYNELDRENRKMCRVDNADANKLVEYLTEKGLTEPSFYWKVKLSDDCRLEHLFYRDSRCLIDYQHFGDVVFVDATYKTNKYDLMCVPIVGMN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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