当前解析结果
SmilChr01G000540| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000540 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000540 |
| 描述 | protein FLC EXPRESSOR-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 11112931 - 11117794 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006587 |
|---|---|
| GeneID | 131006587 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006587 |
| 原始查询 | SmilChr01G000540 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein FLC EXPRESSOR-like |
| 产物 | protein FLC EXPRESSOR-like |
| Arabidopsis | AT3G14750 (AT3G14750)structural maintenance of chromosomes domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820703] identity=36.7; qcov=0.908; evalue=3.2e-45; confidence=medium |
| Rice | Os03g0818000- identity=42.7; qcov=0.832; evalue=3.37e-41; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006587 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.60000 | XP_057789731.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057789731.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057789732.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789731.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789731.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:11113117 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:11113155 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
Chr1:11113156 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B77,C61 |
Chr1:11113320 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B129,D10 |
Chr1:11113417 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr1:11114157 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B13 |
Chr1:11117395 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B104,D11 |
Chr1:11117395 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B104,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。