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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000542`

染色体: Chr01 坐标: 11124162-11125049 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000542`
名称	SmilChr01G000542
描述	uncharacterized SmilChr01G000542
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	11124162 - 11125049 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019431`
GeneID	`131019431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019431`
原始查询	`SmilChr01G000542`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G42905` (AT5G42905) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834302] identity=29.9; qcov=0.59; evalue=6.74e-08; confidence=low
Rice	`Os06g0683500` - identity=29.9; qcov=0.431; evalue=4.95e-12; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803993.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803993.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803993.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803993.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:11124166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B69,B98,C61
`Chr1:11124224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr1:11124245`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B73,B78,C56,C63,C67,C87
`Chr1:11124261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C36
`Chr1:11124314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B101,B54,B68,C36,C87
`Chr1:11124314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B54,B68,C36,C87
`Chr1:11124341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B82,C12,C45,C49
`Chr1:11124385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B38,B39,C38,D11
`Chr1:11124389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C75
`Chr1:11124389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:11124433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A18,B10,B102,B119,B120,B123,B125,B134,B25,B27,B34,B4,B42,B70,B75,B77,B8,B80,B87,C17,C21,C3,C38,C39,C63,C9,D8
`Chr1:11124452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803993.1

295 aa

148

295

RVT_3

PF13456 RVT_3 144-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803993.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	144	264	4.3e-18	66.1	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948010.1
ATGGACCATATCTTATGGTCTTGTGACTGCGTTAGACCTGTTTGGCTGGAGTTCTTGAGTTGGTTTCAATTGACGGAGGCCGCTGATGCTGTTGATATGCATAGTTTTTTTGTTCGCGCCTGGTGTTATAAGTTCAGCTCTCAGCTGGATTGTTATTGGCGTGCTGGAATTATTACTATCTTATGGGCCATTTGGACTCTGAGGAACTCTTGCATCTTTGATAACAAGATTTTTGAACAAAGGCGGATCATCCATTTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019431
ATGGACCATATCTTATGGTCTTGTGACTGCGTTAGACCTGTTTGGCTGGAGTTCTTGAGTTGGTTTCAATTGACGGAGGCCGCTGATGCTGTTGATATGCATAGTTTTTTTGTTCGCGCCTGGTGTTATAAGTTCAGCTCTCAGCTGGATTGTTATTGGCGTGCTGGAATTATTACTATCTTATGGGCCATTTGGACTCTGAGGAACTCTTGCATCTTTGATAACAAGATTTTTGAACAAAGGCGGATCATCCATTTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803993.1
MDHILWSCDCVRPVWLEFLSWFQLTEAADAVDMHSFFVRAWCYKFSSQLDCYWRAGIITILWAIWTLRNSCIFDNKIFEQRRIIHFVRVAFKEMENSFNLGHMNNSWKDYTILRSIGVATRAAPPPDFIAVHWWPPVSPWIKVNTDGSAIGAPGNIAAGGVFRDNFSWVRGCFHYKGGVGFAFEAELLAVIKAIFIAHDRGWLHLWIESDSMYIVHLLEERSTAVPWRFIALWNKVLHLLPDFTLQISHIYRERNKAADI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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