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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000555`

染色体: Chr01 坐标: 11571615-11573693 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000555`
名称	SmilChr01G000555
描述	uncharacterized SmilChr01G000555
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	11571615 - 11573693 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019997`
GeneID	`131019997`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019997`
原始查询	`SmilChr01G000555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=26.5; qcov=0.588; evalue=1.72e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019997

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804642.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057804642.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057804642.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057804642.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804642.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:11571625`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A5,B102,B113,B115,B137,B20,B41,B47,B62,B68,B9,C11,C25,C43,C51,C61,C62,C67,C72,D2
`Chr1:11571627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C61
`Chr1:11571652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B129
`Chr1:11571666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B26,C16,C56
`Chr1:11571667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr1:11571669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr1:11571672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:11571686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:11571687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B22,C51,C65,C80
`Chr1:11571697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B25,B26,C16,C56
`Chr1:11571701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C8
`Chr1:11571703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,C2,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804642.1

692 aa

346

692

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 33-98 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804642.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	33	98	5.9e-11	43.3	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948659.1
ATGGGCTCATCACACCCCACTAACAGCAGGAGTCCTTTCTCCGCTGACATTTTGGTGGATACTCTGCCAAGGAGCTATAAGCCCATTTCGCTGGACTATGATGGTACCACTGACCCGGAAGTACACCTCAACCGGTTTGAGGGGCTGGTCACACTTCATATGTACACTGAGGGCATCAAGTGCTGCATATTCTCCACCACTTTAACTGGACCTGCCCAGTTGTGGTTCGGGACGTTCGTCCCAAATTCTATTCACTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019997
ATGGGCTCATCACACCCCACTAACAGCAGGAGTCCTTTCTCCGCTGACATTTTGGTGGATACTCTGCCAAGGAGCTATAAGCCCATTTCGCTGGACTATGATGGTACCACTGACCCGGAAGTACACCTCAACCGGTTTGAGGGGCTGGTCACACTTCATATGTACACTGAGGGCATCAAGTGCTGCATATTCTCCACCACTTTAACTGGACCTGCCCAGTTGTGGTTCGGGACGTTCGTCCCAAATTCTATTCACTCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804642.1
MGSSHPTNSRSPFSADILVDTLPRSYKPISLDYDGTTDPEVHLNRFEGLVTLHMYTEGIKCCIFSTTLTGPAQLWFGTFVPNSIHSFEGLQARFLRQFASSRRVGKSALSLMDIKQDQNETLREYIARFNLAALEVPEVESQIKNCAYVRGLKPGLFFDELQIRPARDFDDIMSRLPGYLQLEDARMAQKAEIDKQKAKRAEEAPERNNRHQDRAPFRGLPPRVPPSQVEVPPRQQRTVNEVNRFDEYTPQKKPQEKIFH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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