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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000567`

染色体: Chr01 坐标: 11739553-11742456 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000567`
名称	SmilChr01G000567
描述	uncharacterized SmilChr01G000567
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	11739553 - 11742456 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006609`
GeneID	`131006609`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006609`
原始查询	`SmilChr01G000567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsRpt1b; symbol=OsRpt1b; hit=Os02g0784700; species=rice; confidence=weak
产物	OsRpt1b; symbol=OsRpt1b; hit=Os02g0784700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G53750` (RPT1A) regulatory particle triple-A 1A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841812] identity=75; qcov=0.254; evalue=2.18e-08; confidence=weak
Rice	`Os02g0784700` (OsRpt1b) - identity=75; qcov=0.254; evalue=1.33e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21236 (OB_PRS7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006609

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789768.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789768.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789768.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789768.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789768.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:11740121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B137,B25,B69,C41
`Chr1:11740194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:11740380`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C78
`Chr1:11740380`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C78
`Chr1:11740391`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C78
`Chr1:11740391`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C78
`Chr1:11742087`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A11,B60,C73,C74,C83
`Chr1:11742087`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A11,B60,C73,C74,C83
`Chr1:11742094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B60,C73,C74,C83
`Chr1:11742149`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C64,C66
`Chr1:11742149`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:11742159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B137,B25,C41,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789768.1

126 aa

126

OB_PRS7

PF21236 OB_PRS7 63-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789768.1`	Pfam	`PF21236`	OB_PRS7	Domain	63	95	1.3e-10	41.4	26S proteasome regulatory subunit 7, OB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933785.1
TACTTAGGCGGACGCAGCTTTCGATTTCACAAAGTTTCCCCCATCTATTTTTCATCTCCTTCGAAAACACCACACATCCCACTTCAAATTCCCAATTGCCGGCGAGCTGGCCGTCCCCACAGCCTCCCACGGTCGCCCCCTCCGACTCGCGAGACTCTCGCGCCTCTGCGTTGGACCAACTCTGCCGTCGATGTGTAGATCCACCTCCGCCAACACCTCGCCGCCGCTGCAGAGGAGGTGCCGACCTCCGACGCCCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006609
ATGTGTAGATCCACCTCCGCCAACACCTCGCCGCCGCTGCAGAGGAGGTGCCGACCTCCGACGCCCGACGCCAGCAGCCGCTCGCCGTCCGACGCCAGCAGCCACTGCCGTCTCGGAGTCCAATTTGAGGTTAGATTTGACGCCACCGCCGAGGATTTGCAGTCAGCCACCGCCGTCTCCCAATCAAAGGTTGCTCGCTGTACAAAGATAATCAATCCAAACACTGGAGATGCAAAGTATATTATCAATGTCAAGCAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789768.1
MCRSTSANTSPPLQRRCRPPTPDASSRSPSDASSHCRLGVQFEVRFDATAEDLQSATAVSQSKVARCTKIINPNTGDAKYIINVKQIAMIVGGVSSARGSRGRGGGSSGRGAPSSSNPTSSTRCMN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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