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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000589`

染色体: Chr01 坐标: 12816876-12820859 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000589`
名称	SmilChr01G000589
描述	protein GAMETE CELL DEFECTIVE 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	12816876 - 12820859 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006620`
GeneID	`131006620`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006620`
原始查询	`SmilChr01G000589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GAMETE CELL DEFECTIVE 1, mitochondrial
产物	protein GAMETE CELL DEFECTIVE 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G62270` (GCD1) ribosomal protein L20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836348] identity=56.5; qcov=0.905; evalue=6.69e-121; confidence=high
Rice	`Os01g0801700` (OsGCD1) - identity=68.2; qcov=0.73; evalue=8.97e-145; confidence=high
GO	-
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12298 (Bot1p)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006620

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057789780.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057789780.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789780.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789780.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789780.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:12816888`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A13,B105,B78,B95,C60,C83,D7
`Chr1:12816967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:12817009`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A11,A5,B103,B105,B106,B109,B114,B131,B134,B136,B138,B139,B15,B20,B24,B28,B31,B38,B39,B44,B57,B58,B59,B6,B62,B68,B71,B74,B76,B79,B91,B94,B95,B97,C10,C11,C12,C13,C20,C21,C28,C30,C31,C43,C51,C54,C6,C65,C69,C7,C72,C73,C74,C8,C85,C86,D1,D2,D3
`Chr1:12817011`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A18,B110,B124,B16,B6,B8,B88,C22,C67
`Chr1:12817017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A18,B110,B124,B16,B6,B8,B88,C22,C67
`Chr1:12817045`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	173	A1,A10,A13,A15,A18,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B107,B11,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B137,B139,B14,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B23,B26,B27,B28,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B4,B41,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B54,B55,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B70,B72,B73,B77,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B89,B9,B93,B95,B98,B99,C1,C10,C11,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C27,C28,C29,C30,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C61,C62,C65,C69,C7,C70,C72,C73,C75,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D2,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr1:12817432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr1:12817451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B53,B63,D10
`Chr1:12820083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B95,C34,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789780.1

430 aa

215

430

Bot1p

PF12298 Bot1p 226-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789780.1`	Pfam	`PF12298`	Bot1p	Family	226	342	8.8e-08	33.2	Eukaryotic mitochondrial regulator protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933797.1
ACACCAATGCACCGCTTACGACATCCTGCATTGGAGATGCTTTTAGTAGCTTATGCACGAATACTTGTACCTCGATTAAACCCCCAAATTCCTAAGTCTAAAACCATCACAAATCAGAGAAACCCTGAATCAAGCCTTCATCAAAGCTCTCTCTCACTTCGCCCTCTCTCTTTCTCTCTAAACAAAATGCGAGGCCTTCTTCGCACATTGACGCAGCTCACCATCAATGCCAACACTAAGACCGCGCAGCTTCACAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006620
ATGCACCGCTTACGACATCCTGCATTGGAGATGCTTTTAGTAGCTTATGCACGAATACTTGTACCTCGATTAAACCCCCAAATTCCTAAGTCTAAAACCATCACAAATCAGAGAAACCCTGAATCAAGCCTTCATCAAAGCTCTCTCTCACTTCGCCCTCTCTCTTTCTCTCTAAACAAAATGCGAGGCCTTCTTCGCACATTGACGCAGCTCACCATCAATGCCAACACTAAGACCGCGCAGCTTCACAATCCACGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789780.1
MHRLRHPALEMLLVAYARILVPRLNPQIPKSKTITNQRNPESSLHQSSLSLRPLSFSLNKMRGLLRTLTQLTINANTKTAQLHNPRPLLTLQKPFSTQGGGGDKEGDWTLHFGGTGSSGPDPMSWDEGSSSWSTGLTKEHFDGEVVGKKVGASDPTVTQPRAVGSNQTRRPAYSDARWTDDELAKMRELEAANRWGKGFVDSWDDKMHETAMLMKQVREPGARGSYLKDSEKAEMYKKHKENPEEYSVERLAKDYRIMRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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