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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000591`

染色体: Chr01 坐标: 12877943-12878883 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000591`
名称	SmilChr01G000591
描述	uncharacterized SmilChr01G000591
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	12877943 - 12878883 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021733`
GeneID	`131021733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021733`
原始查询	`SmilChr01G000591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=25.8; qcov=0.613; evalue=2.51e-12; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00665 (rve)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057807026.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057807026.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057807026.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807026.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807026.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:12877952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr1:12877986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B114,B126,B57,D4
`Chr1:12877986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B126,B57,D4
`Chr1:12877989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C20,C30,C51,D4
`Chr1:12878023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C15,C73
`Chr1:12878038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B64,B76,C20
`Chr1:12878039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:12878067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A23,A6,A7,B104,B12,B20,B97,C13,C20,C44,D2
`Chr1:12878068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A2,B119,B136,B47,C18,C3,C39
`Chr1:12878129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A2,A20,B11,B136,B47,B52,C10,C18,C39,C87
`Chr1:12878183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,C51,C63
`Chr1:12878190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B11,B57,C2,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807026.1

297 aa

148

297

rve

PF00665 rve 12-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807026.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	12	106	1.2e-16	61.5	Integrase core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951043.1
ATGCCGCAAGTCCCAATCATGCATGTTGAAGTTTTTGATGTGTGGGGGATTAAGTTTATAGGACCCTTCCCAAAGTCAAAGAACTATAAATACATCCTGGTAGCAGTGGACTACGTGTCAAAGTGGGTCGAAGCCAAAGCAACTGCAAGAAATGATGCTCACACCGTGGCCGAATTTTTGAAGGAACAAGTGTTCGAGAGATTTGGTGTACCCAAGATCCTAATCAGTGATCAAGGATCTCACTTTTGTAATGCCACCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021733
ATGCCGCAAGTCCCAATCATGCATGTTGAAGTTTTTGATGTGTGGGGGATTAAGTTTATAGGACCCTTCCCAAAGTCAAAGAACTATAAATACATCCTGGTAGCAGTGGACTACGTGTCAAAGTGGGTCGAAGCCAAAGCAACTGCAAGAAATGATGCTCACACCGTGGCCGAATTTTTGAAGGAACAAGTGTTCGAGAGATTTGGTGTACCCAAGATCCTAATCAGTGATCAAGGATCTCACTTTTGTAATGCCACCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807026.1
MPQVPIMHVEVFDVWGIKFIGPFPKSKNYKYILVAVDYVSKWVEAKATARNDAHTVAEFLKEQVFERFGVPKILISDQGSHFCNATIRALNKKAGVTHKVTTTYHPQANGQAEISNREIKSILEKVVHPNRKDWSNLLGDALWAYRTAFKTPIGEIEHKAYWAIKQINLSMSLAGEARKLQMSELEELRLEAYENAVLYKERTRRIHDAKIRKKEFWTGQKVLLFNSRFKMMAGKLCSKWSGLFVIKEIFSNGSTEVYDH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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