当前解析结果
SmilChr01G000608| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000608 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000608 |
| 描述 | probable protein phosphatase 2C 26 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 13458375 - 13460408 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006642 |
|---|---|
| GeneID | 131006642 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006642 |
| 原始查询 | SmilChr01G000608 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable protein phosphatase 2C 26 |
| 产物 | probable protein phosphatase 2C 26 |
| Arabidopsis | AT2G30170 (PBCP)Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817569] identity=67.9; qcov=0.785; evalue=3.34e-97; confidence=high |
| Rice | Os01g0164600 (OsPP2C01)- identity=71.4; qcov=0.74; evalue=5.65e-100; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006642 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057789795.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.80000 | XP_057789796.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789795.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789795.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789795.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:13459135 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:13459638 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:13459832 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | A20,B138 |
Chr1:13459832 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | A20,B138 |
Chr1:13460134 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B85 |
Chr1:13460134 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。