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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000618`

染色体: Chr01 坐标: 13615259-13616095 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000618`
名称	SmilChr01G000618
描述	uncharacterized SmilChr01G000618
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	13615259 - 13616095 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022538`
GeneID	`131022538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022538`
原始查询	`SmilChr01G000618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.9; qcov=1.01; evalue=2.23e-24; confidence=weak
Rice	`Os09g0268600` - identity=33; qcov=0.982; evalue=8.48e-42; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808060.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808060.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808060.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808060.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808060.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:13615294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr1:13615342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:13615406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B32,C37,D5
`Chr1:13615483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr1:13615494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A18,B12,B2,B28,B32,B79,C18,C37,C87,D4,D5
`Chr1:13615518`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B104,B129,D10
`Chr1:13615518`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B104,B129,D10
`Chr1:13615565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B75
`Chr1:13615565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:13615694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B57,B90,D7
`Chr1:13615762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A10,A14,A2,A20,A21,A4,A6,A8,B106,B108,B113,B118,B124,B133,B134,B140,B17,B19,B2,B30,B35,B38,B41,B48,B53,B59,B70,B71,B75,B76,B77,B8,B82,B84,B89,C15,C19,C25,C26,C35,C36,C4,C40,C41,C56,C58,C59,C71,C74,C75,C78,C81,C82,C83,C86
`Chr1:13615805`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A19,B102,B107,B56,B57,B90,B96,C1,C15,C21,C29,C51,C63,C66,D6,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808060.1

278 aa

139

278

SWIM

PF04434 SWIM 154-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808060.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	154	183	1.2e-06	28.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952077.1
ATGAACTGGAAGAAGGAAAACAAAGGAGCAACACTGAAGAATTTATTTTGGAAGGCTGTGAGATCAACTATGGTGCCGCAGTACAGCAAGGTCTTTGAAGAGATGAAGAGTGAAAGTATTGGAGCTTATCAAGATTTCATTGGGAGGGAGGTGGCTAAATTCTGTAAGCCTTTCTTGTCATGCATTCCTAAGTCTGATATGGTAGATAATAATATAAGTGAAACGTTCAACGGATGGATACTTAGTGCTAGAGGTAGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022538
ATGAACTGGAAGAAGGAAAACAAAGGAGCAACACTGAAGAATTTATTTTGGAAGGCTGTGAGATCAACTATGGTGCCGCAGTACAGCAAGGTCTTTGAAGAGATGAAGAGTGAAAGTATTGGAGCTTATCAAGATTTCATTGGGAGGGAGGTGGCTAAATTCTGTAAGCCTTTCTTGTCATGCATTCCTAAGTCTGATATGGTAGATAATAATATAAGTGAAACGTTCAACGGATGGATACTTAGTGCTAGAGGTAGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808060.1
MNWKKENKGATLKNLFWKAVRSTMVPQYSKVFEEMKSESIGAYQDFIGREVAKFCKPFLSCIPKSDMVDNNISETFNGWILSARGRHLIHMMEEIRTSLMVRQVKKLHNMAEYTDRICPMINKKLETLKYEARNMNPLPALHDKFEVDDSGEKYVVNIPEKICSCRMWELTGIQCKHVVCAIRYLKEEPSTYVCDYYTVDRYLQAYKYALEPLNGEMLWPQCEGDKIKPPLVKNMPGRPKKNRVRDPLEVDPKNRLKRKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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