当前解析结果
SmilChr01G000620| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000620 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000620 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000620 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 13725092 - 13726006 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006650 |
|---|---|
| GeneID | 131006650 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006650 |
| 原始查询 | SmilChr01G000620 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817573]; symbol=AT2G30230; hit=AT2G30230; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817573]; symbol=AT2G30230; hit=AT2G30230; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G30230 (AT2G30230)6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817573] identity=55.4; qcov=1.17; evalue=3.03e-53; confidence=high |
| Rice | Os01g0165600- identity=48.5; qcov=1.15; evalue=5.8e-46; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF14009 (PADRE) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006650 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057789801.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789801.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789801.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789801.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789801.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:13725445 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr1:13725601 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057789801.1PF14009
PADRE 1-148 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057789801.1 |
Pfam | PF14009 |
PADRE | Domain | 1 | 148 | 1.3e-35 | 124.2 | PADRE domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。