当前解析结果
SmilChr01G000623| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000623 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000623 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000623 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 13960398 - 13960724 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023320 |
|---|---|
| GeneID | 131023320 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023320 |
| 原始查询 | SmilChr01G000623 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023320 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057808866.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057808866.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057808866.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808866.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808866.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:13960435 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B19,B27,C56,C60 |
Chr1:13960442 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr1:13960461 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B25,C42,C80 |
Chr1:13960475 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A8,B19,B27,C56,C60 |
Chr1:13960475 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B19,B27,C56,C60 |
Chr1:13960572 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 65 | A11,A2,A5,B103,B105,B106,B114,B131,B134,B136,B139,B15,B20,B24,B25,B28,B31,B38,B39,B44,B57,B58,B6,B62,B68,B71,B76,B79,B8,B80,B81,B91,B94,B95,B97,B98,B99,C10,C11,C12,C13,C15,C20,C21,C28,C30,C31,C43,C51,C53,C54,C6,C65,C69,C7,C72,C73,C74,C8,C85,C86,D11,D2,D3,D9 |
Chr1:13960613 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B109 |
Chr1:13960613 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr1:13960635 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B134 |
Chr1:13960635 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr1:13960636 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | A18,B110,B124,B134,B16,B6,B8,B88,C22,C67 |
Chr1:13960653 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B47,B53,B63 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。