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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000627`

染色体: Chr01 坐标: 14049918-14050849 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000627`
名称	SmilChr01G000627
描述	uncharacterized SmilChr01G000627
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	14049918 - 14050849 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023582`
GeneID	`131023582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023582`
原始查询	`SmilChr01G000627`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=37.1; qcov=0.756; evalue=8.57e-39; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=41.7; qcov=1.13; evalue=2.96e-71; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809133.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057809133.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809133.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809133.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:14049924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B37,B7,C42
`Chr1:14049940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B86,C38,C39,D3
`Chr1:14049945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B44,C29
`Chr1:14049945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C29
`Chr1:14049951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr1:14049956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C59
`Chr1:14049964`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A1,A25,B108,B24,B46,B47,C20,C23,C48,C78,C9
`Chr1:14049997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr1:14050035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B130,B57,B59,C71
`Chr1:14050037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C25
`Chr1:14050050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B35,B83,D9
`Chr1:14050064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809133.1

271 aa

136

271

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 14-206 aa PF13359 DDE_Tnp_4 51-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809133.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	14	206	2.9e-64	217.2	Plant transposon protein
`XP_057809133.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	51	197	1.4e-07	32.0	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953150.1
ATGCTAGCAAATGGTGGAGCAGCTGACCAGTACGACGAGTACCTACGGATTGCGGAGTCTACTTCGTTGGATTGCATGGGCCGCTTCTGTGCGGTGGTCATCCTACGCTTCGACACGGAAATTGTCCAGTGGCATGGCACGAAGCATACACTCGAGTTGATCAGGGGGAGCCGATCGACTATAATCCTTGAAGCTGTCGCCTCCCAAGATTTATGGATCTGGCACGCATTCTTTGGGACTCCTGGTGCAAACAACGACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023582
ATGCTAGCAAATGGTGGAGCAGCTGACCAGTACGACGAGTACCTACGGATTGCGGAGTCTACTTCGTTGGATTGCATGGGCCGCTTCTGTGCGGTGGTCATCCTACGCTTCGACACGGAAATTGTCCAGTGGCATGGCACGAAGCATACACTCGAGTTGATCAGGGGGAGCCGATCGACTATAATCCTTGAAGCTGTCGCCTCCCAAGATTTATGGATCTGGCACGCATTCTTTGGGACTCCTGGTGCAAACAACGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809133.1
MLANGGAADQYDEYLRIAESTSLDCMGRFCAVVILRFDTEIVQWHGTKHTLELIRGSRSTIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGANNDINVLNSSTLFHDQLEGRAPPVTFQVNNSFYQKGYYLTNGIYPNWPMFVKSPTHHIDEKSKRFKVMQEAARKDIERAFGVLQAQWAIIKGPVCLWSKAEFSDIMFTCIILHNMIVQDEGDHAIKWADESNDEASSSSAAARPHRGAPPEFRQYVAREASIRDAEMHARLTLDLKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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