当前解析结果
SmilChr01G000634| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000634 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000634 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000634 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 14270515 - 14271940 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023803 |
|---|---|
| GeneID | 131023803 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023803 |
| 原始查询 | SmilChr01G000634 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=37.7; qcov=0.305; evalue=2.8e-13; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023803 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809424.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057809424.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057809424.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809424.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809424.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:14270525 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B83,B90,B92,D3 |
Chr1:14270527 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B44,C9 |
Chr1:14270539 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B59,B8,C27 |
Chr1:14270552 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C56,C60 |
Chr1:14270556 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B62,D11 |
Chr1:14270571 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | A4,B41,B86,C14 |
Chr1:14270571 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B41,B86,C14 |
Chr1:14270573 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr1:14270596 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | C29,C54,C56 |
Chr1:14270596 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | C29,C54,C56 |
Chr1:14270602 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C68 |
Chr1:14270602 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。