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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000645`

染色体: Chr01 坐标: 14439939-14443084 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000645`
名称	SmilChr01G000645
描述	exosome complex exonuclease RRP46 homolog
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	14439939 - 14443084 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006682`
GeneID	`131006682`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006682`
原始查询	`SmilChr01G000645`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exosome complex exonuclease RRP46 homolog
产物	exosome complex exonuclease RRP46 homolog
Arabidopsis	`AT3G46210` (AT3G46210) Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823766] identity=69.6; qcov=0.554; evalue=5.31e-23; confidence=medium
Rice	`Os03g0854200` (RRP46) - identity=52.2; qcov=0.683; evalue=1.49e-14; confidence=low
GO	GO:0000176 (nuclear exosome (RNase complex)); GO:0000177 (cytoplasmic exosome (RNase complex)); GO:0005730 (nucleolus); GO:0016075 (rRNA catabolic process); GO:0034427 (GO:0034427); GO:0034475 (U4 snRNA 3'-end processing); GO:0071028 (nuclear mRNA surveillance); GO:0071051 (poly(A)-dependent snoRNA 3'-end processing)
KEGG	-
Pfam	PF01138 (RNase_PH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006682

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789833.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789833.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057789833.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789833.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:14442029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:14442223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr1:14442225`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A13,A16,A21,A25,A3,B11,B112,B118,B12,B125,B136,B138,B18,B20,B21,B26,B3,B31,B33,B76,B9,B95,C11,C22,C25,C41,C43,C46,C57,C58,C65,C69,C73,C78,C84,D4
`Chr1:14442244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C57,C68
`Chr1:14442259`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B111,C17,C27,C30,C5,C75,C76
`Chr1:14442261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:14442402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B55,C6
`Chr1:14442404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:14442446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A1,B105,B33,B46,B56,B79,C62,C74
`Chr1:14442539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:14442545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789833.1

101 aa

101

RNase_PH

PF01138 RNase_PH 35-63 aa

XP_057789834.1

101 aa

101

RNase_PH

PF01138 RNase_PH 35-63 aa

XP_057789835.1

101 aa

101

RNase_PH

PF01138 RNase_PH 35-63 aa

XP_057789836.1

101 aa

101

RNase_PH

PF01138 RNase_PH 35-63 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789833.1`	Pfam	`PF01138`	RNase_PH	Domain	35	63	1.4e-05	26.2	3' exoribonuclease family, domain 1
`XP_057789834.1`	Pfam	`PF01138`	RNase_PH	Domain	35	63	1.4e-05	26.2	3' exoribonuclease family, domain 1
`XP_057789835.1`	Pfam	`PF01138`	RNase_PH	Domain	35	63	1.4e-05	26.2	3' exoribonuclease family, domain 1
`XP_057789836.1`	Pfam	`PF01138`	RNase_PH	Domain	35	63	1.4e-05	26.2	3' exoribonuclease family, domain 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095697.1
TTAATGGGACTCTTGTTCAAAAATGTCTTATCCAATCTAATCACTACTATGAATTATACTATTTCTGCGCTGCCTTAAACTAAATTAAATTGAAAAGAATACACTTTCCACAAATCTGTAGTCTATAAATTTTTTGAATTTTTTTAATAAAAAATTAAATTAACTTAATTCATTAAATTGGAAAACAATAAACAGAAAAGTTAAAAATGGAAAAAATTGTTCCAACTTTCTATTTGTTCGTTTTTTCCCCCAAATGCCAA...

XR_009095693.1
AAAAATGTCTTATCCAATCTAATCACTACTATGAATTATACTATTTCTGCGCTGCCTTAAACTAAATTAAATTGAAAAGAATACACTTTCCACAAATCTGTAGTCTATAAATTTTTTGAATTTTTTTAATAAAAAATTAAATTAACTTAATTCATTAAATTGGAAAACAATAAACAGAAAAGTTAAAAATGGAAAAAATTGTTCCAACTTTCTATTTGTTCGTTTTTTCCCCCAAATGCCAAAGAAAAGCCCTTGAGGAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131006682
ATGTTGGACCGTGTAAAAGAGCACATCAAACATAAAGGCTTTCAGGTCGCACCAGCGGAGCTAGAAGAGCTACTTCTCACTCATCTTGAAATAGTGGATGATGCTGTTAGGGTTGTCCATGACGATGGTTCTGTTCTTCCATGTGCCATACATGCTTCTTGTGCTGCTCTTGTAGATGCTGGAATCCCTTTGAAATACCTTGCAGTCTTGTTATGTTGCTGTCTCACTGAAAGTGAGAATATTACATTGGACCCGAGCAA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057789833.1
MLDRVKEHIKHKGFQVAPAELEELLLTHLEIVDDAVRVVHDDGSVLPCAIHASCAALVDAGIPLKYLAVLLCCCLTESENITLDPSKLEEQIPITMLEEND

XP_057789834.1
MLDRVKEHIKHKGFQVAPAELEELLLTHLEIVDDAVRVVHDDGSVLPCAIHASCAALVDAGIPLKYLAVLLCCCLTESENITLDPSKLEEQIPITMLEEND

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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