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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000660`

染色体: Chr01 坐标: 14726681-14734421 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000660`
名称	SmilChr01G000660
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 20-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	14726681 - 14734421 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006670`
GeneID	`131006670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006670`
原始查询	`SmilChr01G000660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 20-like
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 20-like
Arabidopsis	`AT1G55150` (RH20) DEA(D/H)-box RNA helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841958] identity=46; qcov=0.648; evalue=1.09e-111; confidence=high
Rice	`Os01g0197200` (OsRH20) - identity=44.1; qcov=0.705; evalue=2.45e-108; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789815.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057789815.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057789815.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057789815.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789815.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:14726840`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A9
`Chr1:14726840`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A9
`Chr1:14726898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C66,C83
`Chr1:14726925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:14726994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C31
`Chr1:14727005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr1:14727032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:14729228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B9,C44
`Chr1:14729230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:14730173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B9,C44
`Chr1:14731427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:14732504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789815.1

563 aa

282

563

DEAD

ResIII

Helicase_C

PF00270 DEAD 142-313 aa PF04851 ResIII 162-307 aa PF00271 Helicase_C 349-466 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789815.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	142	313	2.7e-52	177.6	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057789815.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	162	307	5.9e-10	40.0	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057789815.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	349	466	2.8e-33	115.2	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933832.1
AGCCCAACGGAAAGCAGCCCATAGAACCCGAAGCCCAACTCCAAAAACCCCCCCACCCATTTTGGGCAATTTTGCTGCTGCTGCTCTCTCTCTCATTTGCTCTCTATCAGTAAACGTACTCATCCTATCTACCAGCGATGTCGTATGTTCCTCCTCACCTGAGAAACTCTTCCGCCAACCCCGCCTCTGCCGCCAAAACCCTAGTAAACGGAAACTCCGATAATTTCCACTCCAAGCTCAACGGCTCTTACTCTCAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006670
ATGTCGTATGTTCCTCCTCACCTGAGAAACTCTTCCGCCAACCCCGCCTCTGCCGCCAAAACCCTAGTAAACGGAAACTCCGATAATTTCCACTCCAAGCTCAACGGCTCTTACTCTCAATTTGCTTCCGCTAAAACCAACAACAACAATGGCAACTCATTAAATTTGTGGAATGCCGGTTTTCGGGGCTCCGGGAATCACGCCTCATCGGTACCGGAGCCGGTGGCTCCACAGTGGAAGCCGTCCGACCGCGTTATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789815.1
MSYVPPHLRNSSANPASAAKTLVNGNSDNFHSKLNGSYSQFASAKTNNNNGNSLNLWNAGFRGSGNHASSVPEPVAPQWKPSDRVMQLNAEQVEEVCMRLNVDATVPPDSEPAPAPIESFTDMNLHASIMKDIAFHGYTTPTSIQAQAMPIALIGRDLLGCAETGSGKTAAFTIPMIQHCLAQPPIRRGDGPLALVLAPTRELAQQIEKEVKAFSRSLDSFKTAIVVGGTNISEQRSELRAGVNIVVATPGRFIDHLQQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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