当前解析结果
SmilChr01G000661| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000661 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000661 |
| 描述 | protein NETWORKED 4A-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 14734474 - 14736405 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006671 |
|---|---|
| GeneID | 131006671 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006671 |
| 原始查询 | SmilChr01G000661 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein NETWORKED 4A-like |
| 产物 | protein NETWORKED 4A-like |
| Arabidopsis | AT5G58320 (NET4A)Kinase interacting (KIP1-like) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835944] identity=36.1; qcov=1.07; evalue=3.43e-74; confidence=medium |
| Rice | Os01g0168100 (P0028E10.16)- identity=32.6; qcov=1.13; evalue=5.83e-49; confidence=low |
| GO | GO:0003779 (actin binding); GO:0005774 (vacuolar membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07765 (KIP1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006671 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.80000 | XP_057789816.1 |
| 2 | Centrosome | 中心体 | 0.60000 | XP_057789816.1 |
| 3 | Cell projection | 细胞突起 | 0.60000 | XP_057789816.1 |
| 4 | Cilium | 纤毛 | 0.60000 | XP_057789816.1 |
| 5 | Midbody | Midbody | 0.40000 | XP_057789816.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:14734807 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B74,B95,C28 |
Chr1:14734905 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr1:14735103 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,C11,C69 |
Chr1:14735184 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:14735234 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr1:14735280 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr1:14735292 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,B66 |
Chr1:14735322 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,C48 |
Chr1:14735538 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr1:14735571 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:14736172 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr1:14736264 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057789816.1PF07765
KIP1 14-68 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057789816.1 |
Pfam | PF07765 |
KIP1 | Family | 14 | 68 | 1.1e-22 | 80.6 | KIP1-like protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。