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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000676`

染色体: Chr01 坐标: 14952555-14953328 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000676`
名称	SmilChr01G000676
描述	uncharacterized SmilChr01G000676
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	14952555 - 14953328 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025613`
GeneID	`131025613`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025613`
原始查询	`SmilChr01G000676`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=31.3; qcov=0.708; evalue=6.66e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025613

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811417.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811417.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811417.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811417.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811417.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:14952569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr1:14952606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B27
`Chr1:14952656`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A15,A2,A3,B111,B112,B125,B15,B19,B24,B44,B54,B55,B60,B61,B71,B72,B8,C11,C13,C19,C29,C35,C63,C69,C86
`Chr1:14952693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:14952712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,C11,C35,C63,C69
`Chr1:14952756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B85
`Chr1:14952779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A11,A7,B125,B18,B21,B23,B32,B6,B63,B8,B93,C11,C34,C49
`Chr1:14952792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B61,C8
`Chr1:14952798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:14952826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B17
`Chr1:14952827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B92,C28,C75,D3
`Chr1:14952880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811417.1

257 aa

128

257

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 29-194 aa PF03732 PEG10_N-capsid 33-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811417.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	29	194	1.2e-10	41.9	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057811417.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	33	111	3.1e-15	57.0	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955434.1
ATGGCAAGAAACCGCAATGCTAACCGCAACCAAGAAGAGCTGGAACAACTGGCACTCGAACGGATGGACAACTTAATCGAAAGTTTCCAAAAAAAGAAGCCCCCAACTTACAATGGAACGGGGAAGCCTGATGATGCTGAAGAATGGATACGCGGGATTGAAAAAGTCTTCGGGCGCATGCGCTGCAGTACACATGAGAAGGTGGTCTGTGCCACCTACCAGCTCGAGGGAGAAGCAGATCTATGGTGGGAATCCGTGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025613
ATGGCAAGAAACCGCAATGCTAACCGCAACCAAGAAGAGCTGGAACAACTGGCACTCGAACGGATGGACAACTTAATCGAAAGTTTCCAAAAAAAGAAGCCCCCAACTTACAATGGAACGGGGAAGCCTGATGATGCTGAAGAATGGATACGCGGGATTGAAAAAGTCTTCGGGCGCATGCGCTGCAGTACACATGAGAAGGTGGTCTGTGCCACCTACCAGCTCGAGGGAGAAGCAGATCTATGGTGGGAATCCGTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811417.1
MARNRNANRNQEELEQLALERMDNLIESFQKKKPPTYNGTGKPDDAEEWIRGIEKVFGRMRCSTHEKVVCATYQLEGEADLWWESVRRTLTNEAFEAMTWDEFKEAYLTRYITLSFRHKRENEVWKLRQGNCSVEEYDRAFNQLARYAPAHVNTDAKRAERFRQGLRPEIGVPLSIHDTLTYAQALSKALNAEAQLPKEERWQEKRKWEGPQGQSSNQNSKEKKPWAGSNQPNYQKPQVPRPTCPKCKNTLGNAGKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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