当前解析结果
SmilChr01G000681| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000681 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000681 |
| 描述 | uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 15043236 - 15043949 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025677 |
|---|---|
| GeneID | 131025677 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025677 |
| 原始查询 | SmilChr01G000681 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=ATMG00310; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | hit=ATMG00310; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | ATMG00310- identity=42.2; qcov=0.62; evalue=3.5e-40; confidence=medium |
| Rice | Os01g0714225- identity=44; qcov=0.527; evalue=3.54e-33; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025677 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811479.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057811479.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057811479.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811479.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811479.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:15043238 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr1:15043275 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr1:15043278 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C11,C69 |
Chr1:15043278 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr1:15043288 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr1:15043289 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,B85,C27 |
Chr1:15043407 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B104 |
Chr1:15043409 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C86 |
Chr1:15043409 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C86 |
Chr1:15043518 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B44,B65 |
Chr1:15043620 |
CTT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C11,C69 |
Chr1:15043620 |
CTT |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。