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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000693`

染色体: Chr01 坐标: 15565832-15574195 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000693`
名称	SmilChr01G000693
描述	LRR repeats and ubiquitin-like domain-containing protein At2g30105
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	15565832 - 15574195 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006710`
GeneID	`131006710`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006710`
原始查询	`SmilChr01G000693`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LRR repeats and ubiquitin-like domain-containing protein At2g30105
产物	LRR repeats and ubiquitin-like domain-containing protein At2g30105
Arabidopsis	`AT2G30105` (AT2G30105) LRR/ubiquitin-like domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723124] identity=58; qcov=0.976; evalue=1.97e-153; confidence=high
Rice	`Os10g0456200` (OsIRL8) - identity=47.5; qcov=0.378; evalue=1.2e-37; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00240 (ubiquitin); PF00560 (LRR_1); PF11976 (Rad60-SLD); PF12799 (LRR_4); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006710

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789838.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057789838.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789838.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789838.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789838.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:15570963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C25
`Chr1:15573239`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B35
`Chr1:15573239`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B35
`Chr1:15573282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789838.1

373 aa

186

373

ubiquitin

Rad60-SLD

LRR_4

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF00240 ubiquitin 17-85 aa PF11976 Rad60-SLD 24-79 aa PF12799 LRR_4 201-239 aa PF13855 LRR_8 249-305 aa PF00560 LRR_1 271-292 aa PF13855 LRR_8 271-329 aa PF00560 LRR_1 294-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789838.1`	Pfam	`PF00240`	ubiquitin	Domain	17	85	3.2e-18	66.0	Ubiquitin family
`XP_057789838.1`	Pfam	`PF11976`	Rad60-SLD	Family	24	79	6.4e-06	26.6	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like
`XP_057789838.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	201	239	1.2e-15	57.9	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057789838.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	249	305	5.8e-23	81.1	Leucine rich repeat
`XP_057789838.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	271	292	1.3e-14	51.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789838.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	271	329	5.8e-23	81.1	Leucine rich repeat
`XP_057789838.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	294	314	1.3e-14	51.9	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933855.1
TTTTTTTTTTTCTTTTAGAATTTCCAAAGGTACTCTATTATGAGTAGTTTTCATAAATTGAATAAGATTAATTTTTTGGAACGCCCAACCCAACATGAAAATTAGACGGAGGGAGTATTACGCTGGAATTCGAAAAGCTTCGATTTTTTAAAAATTGTTTTGGATTGCCTATTCTTGAGCAAACAAAAGTGTGTGATTATCGAATTGTTAGCGTTGGGAATCTGTAGTGTTAATTCAAAATAATTCATCGAGCTCGGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006710
ATGGATTCGGAAGCGGCGACATCTGGAGAAACAAGCAAATTAAGGTTGAGTGTGAAGTTCGGGGGCCGATCCATACCGGTTGAAATTGCGGCGGACGCCACCATTAAAGACCTTAAACTTATCCTTCAAACGCTCACCGATGTCCTCCCTCGAGGCCAAAAGCTCATCTTCAAAGGGAAAGTTATGTCGGACGAATCGACATTGGCCTCGGCGGATATTAGTGATAGGTCCAAAATTATGCTCATGGCATCACAAGGTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789838.1
MDSEAATSGETSKLRLSVKFGGRSIPVEIAADATIKDLKLILQTLTDVLPRGQKLIFKGKVMSDESTLASADISDRSKIMLMASQGIHQGGGPMKKELPTSRAARGIATEKRKNNEEIVTMSRLERWKLSGVIALSDCGLTTVPEEAWTCGSLARVLDVSHNSLLEVPAEICRLSIIQKLLLNGNLLSDTSIAWDELTSLKHLIVLSLNQNNLASVPPALGALTSLKQLHIANNKLVCIPTEIGLLTDLEVLKAQNNRLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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