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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000697`

染色体: Chr01 坐标: 15672095-15672531 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000697`
名称	SmilChr01G000697
描述	40S ribosomal protein S25-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	15672095 - 15672531 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006713`
GeneID	`131006713`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006713`
原始查询	`SmilChr01G000697`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S25-like
产物	40S ribosomal protein S25-like
Arabidopsis	`AT2G21580` (AT2G21580) Ribosomal protein S25 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816696] identity=80.2; qcov=1; evalue=1.28e-47; confidence=medium
Rice	`Os08g0559200` (RPS25) - identity=77.5; qcov=1; evalue=4.4e-44; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03297 (Ribosomal_S25)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006713

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789841.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789841.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789841.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789841.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789841.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:15672135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:15672210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C11
`Chr1:15672281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C25
`Chr1:15672294`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B40
`Chr1:15672294`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B40
`Chr1:15672296`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B40
`Chr1:15672296`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B40
`Chr1:15672336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:15672339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:15672353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:15672393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B100,B12,C33
`Chr1:15672421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789841.1

111 aa

111

Ribosomal_S25

PF03297 Ribosomal_S25 16-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789841.1`	Pfam	`PF03297`	Ribosomal_S25	Family	16	108	1.5e-38	131.8	S25 ribosomal protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933858.1
CGCAGTACTCGCACATTGCGATGGCTCCCAAAAAGGATAAGGCTCATCCACCATCTTCCAAGCTGGCAAAATCCGGTGGCGGCAAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTCGATAAGTCGACCTACGAAAAATTGCTCACTGAGGCACCTAAGTATAAACTTATCACTCCTTCTGTTCTCTCCGGTCGTCTCAGGATCAGTGGATCATTAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006713
ATGGCTCCCAAAAAGGATAAGGCTCATCCACCATCTTCCAAGCTGGCAAAATCCGGTGGCGGCAAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTCGATAAGTCGACCTACGAAAAATTGCTCACTGAGGCACCTAAGTATAAACTTATCACTCCTTCTGTTCTCTCCGGTCGTCTCAGGATCAGTGGATCATTAGCAAGGAAAGCAATCAGGGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789841.1
MAPKKDKAHPPSSKLAKSGGGKQKKKKKKKWSKGKQKEKVNNMVLFDKSTYEKLLTEAPKYKLITPSVLSGRLRISGSLARKAIRELMARGLIRRVSAHASQQIYTRATNT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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