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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000700`

染色体: Chr01 坐标: 15690510-15692170 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000700`
名称	SmilChr01G000700
描述	uncharacterized SmilChr01G000700
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	15690510 - 15692170 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985358`
GeneID	`130985358`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985358`
原始查询	`SmilChr01G000700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0271500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0271500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0271500` - identity=28.2; qcov=0.859; evalue=2.25e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985358

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764319.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764319.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764319.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764319.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764319.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:15690989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C56
`Chr1:15691146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr1:15691172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:15691181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,C22,C57,D1,D4
`Chr1:15691196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr1:15691206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C64
`Chr1:15691214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B20,B29,C54
`Chr1:15691222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C22
`Chr1:15691253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764319.1

256 aa

128

256

Transpos_assoc

PF13963 Transpos_assoc 5-81 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764319.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	81	2.4e-19	70.0	Transposase-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908336.1
GCTGCTGCTTCCGGTCCGACCGCCGCCGCCGCCCAGCAGTTCGACGACCTCGTTTCACCGCCTTCTTCACGACACCCGCCGGAAACCACCACCAATTTGCAAGAATGAGTGATAATCGTATGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTACTGCATTTGAAACGGGGCTTGAGTTTTTCCTTGAGTGGGCGTTCAATCAAACGGCGTACACAGATGGACAAGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAAGAAGTGCAAGAATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985358
ATGAGTGATAATCGTATGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTACTGCATTTGAAACGGGGCTTGAGTTTTTCCTTGAGTGGGCGTTCAATCAAACGGCGTACACAGATGGACAAGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAAGAAGTGCAAGAATCAAGCGTATTTAGATGTACCTACGGTCAGAAAACATGTTAGTAGGCGTGGATTTGTCCTGAATTACAAAGTTTGGGTTTCTCACGGGGAAGCACCGCTGTATATGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764319.1
MSDNRMWMYARYNDRTAFETGLEFFLEWAFNQTAYTDGQGNIRCPCKKCKNQAYLDVPTVRKHVSRRGFVLNYKVWVSHGEAPLYMPREHAIMNEDDGLYNNYERMVHDHAGPSNYQDPPNLEQPPNNDAQQIYNMLDAADTPLYAGCDTYTQLSWMTQFMSIKTESHMSERTYNQMSSMMKAALPEGNNCPEDFYSTKRNLRGLGLPVEKIDCCVNNCMLYWGETSELHSCMFCDQSRYKDSLRASGSPFTICSP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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