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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000737`

染色体: Chr01 坐标: 16337692-16340651 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000737`
名称	SmilChr01G000737
描述	uncharacterized SmilChr01G000737
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16337692 - 16340651 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006752`
GeneID	`131006752`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006752`
原始查询	`SmilChr01G000737`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=44.5; qcov=0.571; evalue=1.6e-125; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006752

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789859.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057789859.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057789859.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789859.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789859.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16338028`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr1:16338028`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr1:16338032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:16338037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:16338041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,B83
`Chr1:16338106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr1:16338143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B76,C45
`Chr1:16338193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B102
`Chr1:16338193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:16338230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B140,B91,C28
`Chr1:16338230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B91,C28
`Chr1:16338288`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A6,B40,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789859.1

795 aa

398

795

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF02992 Transposase_21 1-145 aa PF13960 DUF4218 339-451 aa PF13952 DUF4216 622-694 aa

XP_057789860.1

795 aa

398

795

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF02992 Transposase_21 1-145 aa PF13960 DUF4218 339-451 aa PF13952 DUF4216 622-694 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789859.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	1	145	5.4e-60	202.9	Transposase family tnp2
`XP_057789859.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	339	451	4.7e-50	168.9	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057789859.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	622	694	4.5e-22	79.1	Domain of unknown function (DUF4216)
`XP_057789860.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	1	145	5.4e-60	202.9	Transposase family tnp2
`XP_057789860.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	339	451	4.7e-50	168.9	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057789860.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	622	694	4.5e-22	79.1	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933877.1
GATGTATGAAACAAACATCTATAATTTTATCCACACTCATCGATGGTCCTAGAAGTCCAGGGAATGATATTGATATTTATTTGCAACCATTGGTTGATGAACTTCAAAGTTTATGGAATCCTGGGGTTTCTACTTATGATGCAACTGCAAAGAGTATGTTCCAATTACGTGCTGCATTATTATGGACTATAAATGACTTTCCAGCCTATGCCATTATTTCAGGTTGGAGTACAAAAGGTGCATATGCATGCCCTTGTTGT...

XM_057933876.1
GATGTATGAAACAAACATCTATAATTTTATCCACACTCATCGATGGTCCTAGAAGTCCAGGGAATGATATTGATATTTATTTGCAACCATTGGTTGATGAACTTCAAAGTTTATGGAATCCTGGGGTTTCTACTTATGATGCAACTGCAAAGAGTATGTTCCAATTACGTGCTGCATTATTATGGACTATAAATGACTTTCCAGCCTATGCCATTATTTCAGGTTGGAGTACAAAAGGTGCATATGCATGCCCTTGTTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006752
ATGAAACAAACATCTATAATTTTATCCACACTCATCGATGGTCCTAGAAGTCCAGGGAATGATATTGATATTTATTTGCAACCATTGGTTGATGAACTTCAAAGTTTATGGAATCCTGGGGTTTCTACTTATGATGCAACTGCAAAGAGTATGTTCCAATTACGTGCTGCATTATTATGGACTATAAATGACTTTCCAGCCTATGCCATTATTTCAGGTTGGAGTACAAAAGGTGCATATGCATGCCCTTGTTGTAATAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789859.1
MKQTSIILSTLIDGPRSPGNDIDIYLQPLVDELQSLWNPGVSTYDATAKSMFQLRAALLWTINDFPAYAIISGWSTKGAYACPCCNKNCQSQWLKNGKKHCYMGHRRFLPSGHKYRTDRIHFDGTIEKAHKPKRLSGPEILEQLNGMVNSFGKREPKKIGEKRRRKEKSPTDFTCRYNWKKLSIFFQLPYWKENLIPHNLDIMHIEKNVLENILWTLLGVAAKTKDNVKSRLDLQILGIRKSLHPQRKGDKFYLQPACFT...

XP_057789860.1
MKQTSIILSTLIDGPRSPGNDIDIYLQPLVDELQSLWNPGVSTYDATAKSMFQLRAALLWTINDFPAYAIISGWSTKGAYACPCCNKNCQSQWLKNGKKHCYMGHRRFLPSGHKYRTDRIHFDGTIEKAHKPKRLSGPEILEQLNGMVNSFGKREPKKIGEKRRRKEKSPTDFTCRYNWKKLSIFFQLPYWKENLIPHNLDIMHIEKNVLENILWTLLGVAAKTKDNVKSRLDLQILGIRKSLHPQRKGDKFYLQPACFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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