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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000738`

染色体: Chr01 坐标: 16360156-16361373 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000738`
名称	SmilChr01G000738
描述	uncharacterized SmilChr01G000738
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16360156 - 16361373 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986188`
GeneID	`130986188`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986188`
原始查询	`SmilChr01G000738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.7; qcov=0.17; evalue=2.13e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986188

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765523.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057765523.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057765523.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765523.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765523.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16360167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B91
`Chr1:16360168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr1:16360180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr1:16360188`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	132	A10,A13,A14,A15,A19,A20,A21,A22,A24,A25,A4,A5,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B113,B115,B117,B118,B12,B120,B121,B125,B126,B127,B128,B13,B130,B131,B134,B135,B136,B137,B16,B2,B20,B22,B25,B27,B36,B37,B40,B41,B45,B46,B47,B48,B49,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B62,B64,B65,B68,B7,B72,B74,B75,B76,B78,B83,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B98,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C2,C22,C27,C28,C30,C33,C35,C37,C38,C39,C4,C41,C46,C47,C50,C51,C55,C58,C60,C61,C64,C65,C66,C67,C69,C70,C72,C73,C75,C78,C80,C81,C82,C83,C87,C9,D1,D10,D3,D5,D7,D9
`Chr1:16360227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr1:16360228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr1:16360237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B72,C72
`Chr1:16360276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B20,B72,C72
`Chr1:16360283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:16360309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:16360314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:16360345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B56,B96,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909540.1
ATGAGATCAGCAGATGAGGAAGAATTTGCCCAAGAGAAAGAGGCAAAGCGAAAGGCGACAGGGAAGGGTAAAGAGAAATCAAGCCAGATTGAGCCCATAATCCCCTTCCCAGGCAGAATGGCCAAGGAACAAGAGAAGGAAGAATTAACCGAACTGGTTAAAATCTTCAAAAAGGTGGAGGTCAATATGCCCCTTTTGGTCGTGCTACGCTCTATGCCCAGATGTACAAAATTTCTCAAAGAACTCTGCACTCGGAAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986188
ATGAGATCAGCAGATGAGGAAGAATTTGCCCAAGAGAAAGAGGCAAAGCGAAAGGCGACAGGGAAGGGTAAAGAGAAATCAAGCCAGATTGAGCCCATAATCCCCTTCCCAGGCAGAATGGCCAAGGAACAAGAGAAGGAAGAATTAACCGAACTGGTTAAAATCTTCAAAAAGGTGGAGGTCAATATGCCCCTTTTGGTCGTGCTACGCTCTATGCCCAGATGTACAAAATTTCTCAAAGAACTCTGCACTCGGAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765523.1
MRSADEEEFAQEKEAKRKATGKGKEKSSQIEPIIPFPGRMAKEQEKEELTELVKIFKKVEVNMPLLVVLRSMPRCTKFLKELCTRKVKYTDDAKFQVGESVSAVLQRDMPIKCGDPGMFYIPCVIGTMKVEKAMLDLGASINVMPLSMYQDLEIGPLKPTRVVIQLADRSNVYPEGILEDVLVKVEELIFLADFYILDMGKSKARDPVMLLGRPFLKTARTRIDCDTGKLTCQFEGETVTFDIYNAMKHPADTEMVKSVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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