当前解析结果
SmilChr01G000740| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000740 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000740 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000740 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 16399374 - 16400258 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986268 |
|---|---|
| GeneID | 130986268 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986268 |
| 原始查询 | SmilChr01G000740 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986268 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057765642.1 |
| 2 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057765642.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057765642.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765642.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765642.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:16399596 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,A20,B24,D2,D6 |
Chr1:16399643 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,B26 |
Chr1:16399658 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C43 |
Chr1:16399697 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr1:16399712 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 20 | A20,A22,B119,B129,B43,B68,B69,B71,B80,B91,C1,C16,C45,C63,C71,C74,C8,C83,C87,D2 |
Chr1:16399727 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A6,B68,B71,C45,C74 |
Chr1:16399741 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B44,C8 |
Chr1:16399741 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B44,C8 |
Chr1:16399742 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B44,C8 |
Chr1:16399742 |
TGC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B44,C8 |
Chr1:16399750 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B124,C13 |
Chr1:16399750 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,C13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。