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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000744`

染色体: Chr01 坐标: 16464060-16468973 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000744`
名称	SmilChr01G000744
描述	uncharacterized SmilChr01G000744
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16464060 - 16468973 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006756`
GeneID	`131006756`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006756`
原始查询	`SmilChr01G000744`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT2G29510; symbol=AT2G29510; hit=AT2G29510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT2G29510; symbol=AT2G29510; hit=AT2G29510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G29510` (AT2G29510) - identity=34.9; qcov=0.632; evalue=8.28e-61; confidence=low
Rice	`Os03g0267600` - identity=31.9; qcov=0.534; evalue=6.9e-44; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12043 (DUF3527)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006756

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057789865.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057789865.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057789865.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789865.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789865.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16466080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:16466270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B70,C25
`Chr1:16466441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr1:16466502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C27,C47
`Chr1:16466703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C11,C69
`Chr1:16466768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B25,B75,C80,D6
`Chr1:16466792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:16466838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B25,B75,C80,D6
`Chr1:16467029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C50
`Chr1:16467143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:16467384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr1:16467550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B63,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789865.1

887 aa

444

887

DUF3527

PF12043 DUF3527 558-667 aa PF12043 DUF3527 675-842 aa

XP_057789866.1

887 aa

444

887

DUF3527

PF12043 DUF3527 558-667 aa PF12043 DUF3527 675-842 aa

XP_057789867.1

887 aa

444

887

DUF3527

PF12043 DUF3527 558-667 aa PF12043 DUF3527 675-842 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789865.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	558	667	6.6e-48	164.7	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789865.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	675	842	6.6e-48	164.7	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789866.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	558	667	6.6e-48	164.7	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789866.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	675	842	6.6e-48	164.7	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789867.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	558	667	6.6e-48	164.7	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789867.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	675	842	6.6e-48	164.7	Domain of unknown function (DUF3527)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933882.1
AATAAAGTAACATTTGCAGAAAGCTACTCTGAGAGGTGCGGACCCCGCCGGATGTGACCTCCCGCGTTTTACTCCTCCATTCTCAGCCGTCCGATCTCATCCATCTCCAGACCTAGAAAAACCACCACATTCTTTTCGAATCCGAATGTGAATCCAACTTGTTCATTGTTTTCTCTCTTTGATTCTGCATTATTCACTTGGAAAAGCCGCTATCAGTTCCGTCTTTGGATCATCGGATTCCGCCCTTTTCCATCTCTGAT...

XM_057933883.1
TCAACTATGATTGCGAATTTTGTTTAATTTTGGAGAATGTGGCCAGTTAAACACATTGTGATTATCGCCGTTTGTTTATTATTTCTGTTCGGTGGCATTTCCTGTTCATTTGGCGCTACGTTAAGAAATTTGATTTCTGTTTGTCAAGCAAATCTAGTTCACTGATGTGGTTTTTGAACCCACCCTCCAATTACGTGTAGATGCAGAAGGTGTGATCTCTCTTGTTTAATTTATTTGAATTTGTGCCTGTGTGGGTTGGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131006756
ATGCATGTTACTAGCAAGATGGGGTTTCATTCAAATGGTGGTGAGGAGTCATATGACACAAAAGCGAGTAAATTAAATATCGGTTTGTCAACCCAACCGAAACAGAGGAAGAAACTGGGGTCCATTTTGAACTTGGAGGAATATGAGAATGATTTACATCCACGAGCTGTGAAGGATGCAGAAAAATCTAAAGGGTTTCATCAGAAGCAACACGACGAAAGAAAGTTGTGCAAAAGTGAAGAAGTTGTTAGGTACATGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057789865.1
MHVTSKMGFHSNGGEESYDTKASKLNIGLSTQPKQRKKLGSILNLEEYENDLHPRAVKDAEKSKGFHQKQHDERKLCKSEEVVRYMSCLPSYLERGENPEKLFNIGVLDWGQLEKWQHSNADILGINVEPSPSSSTSSSFVSSKASSSRPSSKNTMSHHHRKLNRPSTSTGCRSSALELLAGGGETLPKHRNDSNNLLRVQQDLLQATQSSNLDRANWQKDSRRLDPSLQKVTKLRSRPSETDSIVSGFKGNGTLRKGEA...

XP_057789866.1
MHVTSKMGFHSNGGEESYDTKASKLNIGLSTQPKQRKKLGSILNLEEYENDLHPRAVKDAEKSKGFHQKQHDERKLCKSEEVVRYMSCLPSYLERGENPEKLFNIGVLDWGQLEKWQHSNADILGINVEPSPSSSTSSSFVSSKASSSRPSSKNTMSHHHRKLNRPSTSTGCRSSALELLAGGGETLPKHRNDSNNLLRVQQDLLQATQSSNLDRANWQKDSRRLDPSLQKVTKLRSRPSETDSIVSGFKGNGTLRKGEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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