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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000751`

染色体: Chr01 坐标: 16598997-16602119 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000751`
名称	SmilChr01G000751
描述	uncharacterized SmilChr01G000751
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16598997 - 16602119 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986892`
GeneID	`130986892`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986892`
原始查询	`SmilChr01G000751`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=31.6; qcov=0.245; evalue=7.64e-19; confidence=weak
Rice	`Os11g0672600` - identity=32.3; qcov=0.563; evalue=8.13e-51; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986892

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766454.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057766454.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057766454.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766454.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766454.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16599006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr1:16599011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr1:16599033`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	9	B20,B71,B94,C30,C51,C55,C6,C7,D11
`Chr1:16599100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D5
`Chr1:16599109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A4,B103,B47,C61
`Chr1:16599117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A18,B105,B110,B123,B124,B128,B16,B26,B41,B42,B43,B49,B6,B62,B72,B8,B85,B88,B90,B92,C22,C29,C38,C63,C67
`Chr1:16599132`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A14,A21,A8,B102,B107,B124,B15,B22,B37,B38,B39,B53,B58,B60,B68,B7,B71,B83,B88,B94,C13,C25,C26,C3,C42,C48,C5,C59,C73,C77,C82
`Chr1:16599138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:16599177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A4,B103,B47,C61
`Chr1:16599182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:16599195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:16599220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C37,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766454.1

687 aa

344

687

RVT_1

RVT_3

PF00078 RVT_1 121-382 aa PF13456 RVT_3 634-675 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766454.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	121	382	1.3e-24	87.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057766454.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	634	675	2e-05	25.2	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910471.1
ATGGTGCGTGTGATGAGGAAGCTCAAGAGACTTCGTTCCGATCTTCGGACTTGGAATAAAAATGTTTTTGGTAACTTTAATGAGGGTCTTGCCTCTCTTTATGCTGATCTTGGGGCCCTTCAGGAAGACATTGCGGTTTCGGGCTATTCTGAGGAGAGTTTTGACAATGAGATTTCGATCGAGGCCAAGCTTCCTTGGCTCGACAACAGAGTTGTGTCTCTTGGCTCAATGACAGAGATCGCAACACTCATTTCTATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986892
ATGGTGCGTGTGATGAGGAAGCTCAAGAGACTTCGTTCCGATCTTCGGACTTGGAATAAAAATGTTTTTGGTAACTTTAATGAGGGTCTTGCCTCTCTTTATGCTGATCTTGGGGCCCTTCAGGAAGACATTGCGGTTTCGGGCTATTCTGAGGAGAGTTTTGACAATGAGATTTCGATCGAGGCCAAGCTTCCTTGGCTCGACAACAGAGTTGTGTCTCTTGGCTCAATGACAGAGATCGCAACACTCATTTCTATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766454.1
MVRVMRKLKRLRSDLRTWNKNVFGNFNEGLASLYADLGALQEDIAVSGYSEESFDNEISIEAKLPWLDNRVVSLGSMTEIATLISIIIWDIIRDDVSMAIRRFFTHGYLPKGLNSSLLILIHKKQDASRVSDYRPIVVSNFFFKIVTKILACRLNIVAADIVHPHKFGFISRGSIHECIRLASEGVNCMEHYLKGRNMAIKVDILKAFYTISWSFILDILSCFGFSTCFCDWIKVIFDFARISVAFNGSLHRYFACSRGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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