当前解析结果
SmilChr01G000755| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000755 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000755 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000755 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 16623391 - 16625864 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006766 |
|---|---|
| GeneID | 131006766 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006766 |
| 原始查询 | SmilChr01G000755 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830531]; symbol=AT5G06430; hit=AT5G06430; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830531]; symbol=AT5G06430; hit=AT5G06430; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G06430 (AT5G06430)Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830531] identity=60; qcov=0.968; evalue=2.18e-75; confidence=high |
| Rice | Os11g0592900- identity=48.7; qcov=1.04; evalue=8.22e-53; confidence=high |
| GO | GO:0045454 (cell redox homeostasis) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00085 (Thioredoxin) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006766 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057789879.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.60000 | XP_057789879.1 |
| 3 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.20000 | XP_057789879.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789879.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789879.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057789879.1PF00085
Thioredoxin 76-159 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057789879.1 |
Pfam | PF00085 |
Thioredoxin | Domain | 76 | 159 | 2.4e-09 | 37.8 | Thioredoxin |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。