当前解析结果
SmilChr01G000756| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000756 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000756 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000756 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 16629395 - 16630636 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986978 |
|---|---|
| GeneID | 130986978 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986978 |
| 原始查询 | SmilChr01G000756 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=31.8; qcov=0.412; evalue=1.01e-09; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986978 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057766543.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057766543.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057766543.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766543.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766543.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:16629415 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B79,B83,C10 |
Chr1:16629418 |
C |
CCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 12 | A19,B15,B47,B50,B55,B74,C18,C37,C54,C61,C71,C74 |
Chr1:16629424 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B83 |
Chr1:16629424 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr1:16629436 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B79,B83 |
Chr1:16629441 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr1:16629443 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B113,B26,B42,B90,C63 |
Chr1:16629449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C47,C61 |
Chr1:16629454 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B132,C19 |
Chr1:16629511 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr1:16629531 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B73 |
Chr1:16629539 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。