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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000770`

染色体: Chr01 坐标: 16832299-16834935 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000770`
名称	SmilChr01G000770
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16832299 - 16834935 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006773`
GeneID	`131006773`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006773`
原始查询	`SmilChr01G000770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=28; qcov=0.928; evalue=1.34e-34; confidence=low
Rice	`Os07g0525300` - identity=44.5; qcov=1.02; evalue=5.65e-87; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF14372 (hAT-like_RNase-H); PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical); PF27041 (ZBED1_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006773

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789893.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789893.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789893.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789893.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16833251`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B100,B2,B84,C59
`Chr1:16833251`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B100,B2,B84,C59
`Chr1:16833325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B130,B2,B91
`Chr1:16833328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B68,B73,C29,C63
`Chr1:16833350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B42,C47
`Chr1:16833377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C85
`Chr1:16833429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B109,B84
`Chr1:16833446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr1:16833501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C39,C83
`Chr1:16833535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	114	A11,A14,A15,A16,A18,A20,A21,A23,A24,A3,A4,A5,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B109,B113,B12,B129,B131,B136,B137,B140,B15,B16,B17,B2,B21,B25,B27,B28,B30,B32,B33,B34,B36,B4,B44,B46,B48,B49,B51,B52,B54,B56,B59,B60,B62,B63,B64,B65,B69,B70,B73,B77,B78,B79,B8,B80,B85,B86,B88,B89,B9,B92,B96,B98,C10,C17,C18,C2,C21,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C36,C37,C49,C51,C53,C54,C57,C60,C61,C62,C63,C66,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C83,C84,C87,C9,D10,D4,D7,D8
`Chr1:16833582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B117,C57
`Chr1:16833601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B99,C13,C20,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789893.1

304 aa

152

304

ZBED1_RNase-like

ZBED1_RNase-like_helical

hAT-like_RNase-H

PF27041 ZBED1_RNase-like 3-68 aa PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 72-181 aa PF14372 hAT-like_RNase-H 202-293 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789893.1`	Pfam	`PF27041`	ZBED1_RNase-like	Domain	3	68	1.1e-11	45.4	ZBED1 RNase-like domain
`XP_057789893.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	72	181	9e-30	103.7	ZBED1 RNase-like helical domain
`XP_057789893.1`	Pfam	`PF14372`	hAT-like_RNase-H	Domain	202	293	2.9e-26	92.2	hAT-like transposase, RNase-H fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933910.1
GGCAGCCGGCGTGGTTGAAGGCTTTGTTGACCTTGAACGAGATAACAATACCACCGAGGCTTCAAAAGAAAATGAAGCAGATCCAATTAGTGGTGTTACTAAAAAAACAAGTAAGAAAGTCACTTCTGAAGCTTGGGACCACTTTGATAAGATTGTGGAGAAGGGTGTTACAAAGGCGAAGTGCAAATATTGCAAAGCTGTTTTGTCATACAAAGTTTCCACGGGAACTTCTCATCTTCTTAAGCATGCAAAGAAAGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006773
ATGTGTTTGTTTAGGTTTTGTTTTGTACCATCTCCACACACTGCTCCGATTCTTGCAAAGATCTTGATGGATTGTTTGTCTCATTACTCGTTGGATAATAAAATTTCATCGGTTGTACTTGATAATGCCACCACTAATGATGCAATGATGAGTATTTTGAAGGACAATTTGGAAAGTAATTTTCTAATGTTAGGTGGGGAGTTTTTGCATTTGAGGTGTAGTGCTCATATTTTAAACTTGGTTGTTGGGGATGGTTTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789893.1
MCLFRFCFVPSPHTAPILAKILMDCLSHYSLDNKISSVVLDNATTNDAMMSILKDNLESNFLMLGGEFLHLRCSAHILNLVVGDGLKVISHATEKVRDCIVFWMSTPKRVEKFDEACRLLNITKPKRLVLDCKTRWNSTYLMLQTALPFKDVFTKLKRLNRKLKFVPPSEHDWMLAGLVCEKLEIFYKATKVFYGRNHPTSNLFFRKICEIKLALRRWIHSDVEVIRTMADSMIEKFDKYGEHVNGILAIATILDPRNKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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