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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000789`

染色体: Chr01 坐标: 17175442-17177044 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000789`
名称	SmilChr01G000789
描述	uncharacterized SmilChr01G000789
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17175442 - 17177044 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988647`
GeneID	`130988647`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988647`
原始查询	`SmilChr01G000789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831121]; symbol=AT5G12460; hit=AT5G12460; species=arabidopsis; confidence=high
产物	fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831121]; symbol=AT5G12460; hit=AT5G12460; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G12460` (AT5G12460) fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831121] identity=46.9; qcov=0.864; evalue=9.65e-136; confidence=high
Rice	`Os04g0578800` - identity=41.4; qcov=0.852; evalue=1.05e-101; confidence=medium
GO	GO:0008375 (acetylglucosaminyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02434 (Fringe); PF04646 (DUF604)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988647

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057768559.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768559.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768559.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768559.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768559.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17175445`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B33,B48,C61,C62,D2
`Chr1:17175445`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B33,B48,C61,C62,D2
`Chr1:17175699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B27,C19,C82
`Chr1:17175713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr1:17175716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B27
`Chr1:17175904`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C27
`Chr1:17175904`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C27
`Chr1:17175983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A14,A21,A8,B102,B126,B15,B22,B38,B39,B47,B51,B53,B56,B59,B60,B63,B68,B7,B71,B83,B94,B96,C13,C25,C26,C3,C42,C48,C5,C59,C79,C82,C86,D2
`Chr1:17176024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr1:17176035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B139
`Chr1:17176383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B139
`Chr1:17176529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768559.1

479 aa

240

479

Fringe

DUF604

PF02434 Fringe 144-269 aa PF04646 DUF604 206-457 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768559.1`	Pfam	`PF02434`	Fringe	Domain	144	269	8.3e-13	48.9	Fringe-like
`XP_057768559.1`	Pfam	`PF04646`	DUF604	Family	206	457	1.8e-98	329.8	Protein of unknown function, DUF604

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912576.1
ATGTCTTCAAAACTCAATCCACCTGCATCATACACATTATTCAACAAGCTATTTAAGTCTCTCCTCATCTCCGGCTTGCTCATCTATGTCATCTACATCATCAACAACAACAATTCTTGGTTCCACACATCCATTAATAATGCAAGCAACCTCTCTCACCCCCACCCCCACCCTCCCGGGCCCCCTCCTCCAAATACTAATGCAACCCACATAGTCTTCGGAATAGCAGCATCAGCATCTACTTGGAGCCACAGAAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988647
ATGTCTTCAAAACTCAATCCACCTGCATCATACACATTATTCAACAAGCTATTTAAGTCTCTCCTCATCTCCGGCTTGCTCATCTATGTCATCTACATCATCAACAACAACAATTCTTGGTTCCACACATCCATTAATAATGCAAGCAACCTCTCTCACCCCCACCCCCACCCTCCCGGGCCCCCTCCTCCAAATACTAATGCAACCCACATAGTCTTCGGAATAGCAGCATCAGCATCTACTTGGAGCCACAGAAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768559.1
MSSKLNPPASYTLFNKLFKSLLISGLLIYVIYIINNNNSWFHTSINNASNLSHPHPHPPGPPPPNTNATHIVFGIAASASTWSHRKHYVQSWWRPNITRGYVFLDKIQPDLLPWPNHTLPPFRISQDTSKYRDYDRHRARQAIRMALIISEAFDTERPQPQGGVRWFVMADDDTVVFVDNLVEVLRRYDHRKYLYIGMNSETHGSNVMNSFDMAFGGAGYALSYPLAKALAANMDACLKRYPTLYGSDHIVQSCVADLGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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