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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000797`

染色体: Chr01 坐标: 17235549-17237032 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000797`
名称	SmilChr01G000797
描述	replication factor A protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17235549 - 17237032 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006796`
GeneID	`131006796`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006796`
原始查询	`SmilChr01G000797`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication factor A protein 1-like
产物	replication factor A protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G08020` (RPA70B) RPA70-kDa subunit B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830696] identity=28.7; qcov=0.616; evalue=8.12e-07; confidence=low
Rice	`Os07g0190600` - identity=26.7; qcov=0.606; evalue=9.18e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006796

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789919.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057789919.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789919.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789919.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789919.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17235808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:17236037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:17236038`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A13,A7,B1,B100,B108,B111,B113,B114,B118,B13,B134,B15,B21,B29,B31,B41,B49,B58,B62,B63,B72,B83,B93,B96,C12,C18,C2,C22,C23,C24,C31,C41,C42,C5,C50,C51,C55,C57,C64,C66,C76,C82,C84,C86,D1,D9
`Chr1:17236098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr1:17236103`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B65,B89
`Chr1:17236103`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B65,B89
`Chr1:17236135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:17236140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:17236348`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B58,C24,C64,C66
`Chr1:17236348`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B58,C24,C64,C66
`Chr1:17236376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C64,C66
`Chr1:17236401`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B31,B58,C24,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789919.1

198 aa

198

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 43-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789919.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	43	161	3e-17	63.5	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933936.1
ATTAGACGTGGTCTAAGGGGAGAAATGAGCATTAAGTCAACCACTGATATTTCTAGCTGTACTCAAGATTTGAAAAATGACAAGTGGTTCAATACTTCCTTAGCTAGAACCATTAAAGACATCATAAACTCAAATGAGGTTGGCACCTACACGTGCAAAGGGATAATAGTTGACTTTCACCCCACGGAATCATGGTACTACGAAGCATGCGGAAATGAAAGATGTTACAAAGGAATTTCCAAGGGAAGCAAAGTAGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006796
ATGAGCATTAAGTCAACCACTGATATTTCTAGCTGTACTCAAGATTTGAAAAATGACAAGTGGTTCAATACTTCCTTAGCTAGAACCATTAAAGACATCATAAACTCAAATGAGGTTGGCACCTACACGTGCAAAGGGATAATAGTTGACTTTCACCCCACGGAATCATGGTACTACGAAGCATGCGGAAATGAAAGATGTTACAAAGGAATTTCCAAGGGAAGCAAAGTAGGAGATCATTGCAAAAAGTGCAATAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789919.1
MSIKSTTDISSCTQDLKNDKWFNTSLARTIKDIINSNEVGTYTCKGIIVDFHPTESWYYEACGNERCYKGISKGSKVGDHCKKCNKPISKIIIRYCMRVLVEDSGEQTYFTLFEDCAFHLLKKTATQLLDEMESETGDRNGTPDILATLLEREFLFVVDVSMRFGARVCTIKQITEDIQTIAQFSAISRVHDDVEIIE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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