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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000800`

染色体: Chr01 坐标: 17281375-17287044 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000800`
名称	SmilChr01G000800
描述	transcription initiation factor IIA large subunit-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17281375 - 17287044 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006801`
GeneID	`131006801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006801`
原始查询	`SmilChr01G000800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor IIA large subunit-like
产物	transcription initiation factor IIA large subunit-like
Arabidopsis	`AT1G07480` (AT1G07480) Transcription factor IIA, alpha/beta subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837262] identity=57.7; qcov=1.02; evalue=8.68e-116; confidence=high
Rice	`Os05g0292200` - identity=48.6; qcov=1.1; evalue=4.13e-91; confidence=high
GO	GO:0005672 (transcription factor TFIIA complex); GO:0006366 (transcription by RNA polymerase II); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03153 (TFIIA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789925.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057789925.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057789925.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789925.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17284834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:17284836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr1:17284842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,C87
`Chr1:17286325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr1:17286329`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A16,B29
`Chr1:17286329`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A16,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789925.1

404 aa

202

404

TFIIA

PF03153 TFIIA 9-403 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789925.1`	Pfam	`PF03153`	TFIIA	Family	9	403	5.6e-44	152.5	Transcription factor IIA, alpha/beta subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933942.1
GAATTTTGCTAGAATGGGGAGCTCGGCAACCAGTAACGTATACATCCATGTCATTGAAGACGTCATCAGCAAGGTCCGCGACGAGTTCATCAACAATGGCGGCCCGGGCGATGGCGTACTCGATGAGCTCCAAGGATTATGGGAACTGAAGATGATGCAAGCTGGAGCAATTTTGGGGCCGATAGACAGGTCAGCCACGCAAAGGGGGGCCGCTGGTGGTCCTATTACACCTAATCCTGTGCATGACCTCAATGTACCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006801
ATGGGGAGCTCGGCAACCAGTAACGTATACATCCATGTCATTGAAGACGTCATCAGCAAGGTCCGCGACGAGTTCATCAACAATGGCGGCCCGGGCGATGGCGTACTCGATGAGCTCCAAGGATTATGGGAACTGAAGATGATGCAAGCTGGAGCAATTTTGGGGCCGATAGACAGGTCAGCCACGCAAAGGGGGGCCGCTGGTGGTCCTATTACACCTAATCCTGTGCATGACCTCAATGTACCATATGAAGGCACTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789925.1
MGSSATSNVYIHVIEDVISKVRDEFINNGGPGDGVLDELQGLWELKMMQAGAILGPIDRSATQRGAAGGPITPNPVHDLNVPYEGTEEYETPTADLLFPPTPLQTPMQTPLPGTAQTPLPGMAQTPLPGTAQTPLPGNDSSPLYNISTGGTPITPNDYASPNENGGVPEIKGGLGRPSQFMAPPSPWLNQRPRLDVNVAYTEGREEGERGAPHQPSTQEFFLATGKRKRDGPYHPGYIPQQDGASDSLSDESKVNEGGIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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