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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000806`

染色体: Chr01 坐标: 17431542-17434769 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000806`
名称	SmilChr01G000806
描述	transcription factor PCL1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17431542 - 17434769 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006807`
GeneID	`131006807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006807`
原始查询	`SmilChr01G000806`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor PCL1-like
产物	transcription factor PCL1-like
Arabidopsis	`AT5G59570` (BOA) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836076] identity=45.4; qcov=0.994; evalue=8.27e-79; confidence=high
Rice	`Os01g0971800` (OsPCL1) - identity=57.1; qcov=0.643; evalue=1.14e-67; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789939.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789939.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789939.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789939.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17434016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr1:17434373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B37,B57,B59
`Chr1:17434385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B6
`Chr1:17434463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,C20,C27,C41,C47
`Chr1:17434466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789939.1

319 aa

160

319

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 130-179 aa

XP_057789940.1

319 aa

160

319

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 130-179 aa

XP_057789941.1

319 aa

160

319

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 130-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789939.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	130	179	1.7e-08	35.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057789940.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	130	179	1.7e-08	35.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057789941.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	130	179	1.7e-08	35.2	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933957.1
GTGTTTTAGTACCTCAACACAAAAATAGCAGTAGTAAAAAGGTGCGGCGGTGGCAGTTTAGAGTTTGTAAAAGAATCGAGATAAGGGAGCGAGATATTTATTGAAGGATGAATAAATATCTGGGCAGGGTGTCCAGCGTGGAATCTGATATTGCACTTTTTGCACCCAAAAACAAGTTATTTAAATCCGCCCCCACCGCCTCTCTGTCTCTTCCCCCATTTGCATCAATCAATTCACAATCCACAAATTATGTGATTTTG...

XM_057933956.1
GTGTTTTAGTACCTCAACACAAAAATAGCAGTAGTAAAAAGGTGCGGCGGTGGCAGTTTAGAGTTTGTAAAAGAATCGAGATAAGGGAGCGAGATATTTATTGAAGGATGAATAAATATCTGGGCAGGGTGTCCAGCGTGGAATCTGATATTGCACTTTTTGCACCCAAAAACAAGTTATTTAAATCCGCCCCCACCGCCTCTCTGTCTCTTCCCCCATTTGCATCAATCAATTCACAATCCACAAATTATGTGATTTTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131006807
ATGGGTGAGGAAGTGAAGATTGACGACGCCATCTCCGACTGGGAGGCCGGCCTCCCCTCCGCCGACGATCTCACCCCCTTGTCTCAGTGCTTGATCCCACTCGAATTGGCCTCCGCCTTCAGAATCTCGCCGGACCCGCCCCGCACCGCCGTCGACGTCACCCGCGCCTCCCGCACCACTCTCTCCTCCCTCCGCGCCGCCGCCCCCGCCGCCAATTTCAAGCCCTTCGCCGCTCACGCCGACGATCACGCCATGCCCGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057789939.1
MGEEVKIDDAISDWEAGLPSADDLTPLSQCLIPLELASAFRISPDPPRTAVDVTRASRTTLSSLRAAAPAANFKPFAAHADDHAMPDADADDGSDPKKTRRADPADDPAVDNCTDDQSTATAKTLKRPRLVWTPQLHKRFVDVVAHLGLKNAVPKTIMQLMNVEGLTRENVASHLQKYRLYVKRMQGLSNEGPSPSDHLFASTPLPPQSFNESSSAGPSHGNGIANGSHSSVGNGSSANNHMGMPIPMPYPPPPQIMPMQ...

XP_057789940.1
MGEEVKIDDAISDWEAGLPSADDLTPLSQCLIPLELASAFRISPDPPRTAVDVTRASRTTLSSLRAAAPAANFKPFAAHADDHAMPDADADDGSDPKKTRRADPADDPAVDNCTDDQSTATAKTLKRPRLVWTPQLHKRFVDVVAHLGLKNAVPKTIMQLMNVEGLTRENVASHLQKYRLYVKRMQGLSNEGPSPSDHLFASTPLPPQSFNESSSAGPSHGNGIANGSHSSVGNGSSANNHMGMPIPMPYPPPPQIMPMQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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