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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000809`

染色体: Chr01 坐标: 17474079-17474833 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000809`
名称	SmilChr01G000809
描述	uncharacterized SmilChr01G000809
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17474079 - 17474833 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989445`
GeneID	`130989445`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989445`
原始查询	`SmilChr01G000809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=low
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=61.9; qcov=0.447; evalue=4.28e-20; confidence=low
Rice	`Os09g0290900` - identity=55.6; qcov=0.447; evalue=4.84e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989445

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769458.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057769458.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769458.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769458.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17474111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B106,B112
`Chr1:17474113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B55,B79,C16,C38
`Chr1:17474139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B34,B39,C47,C74
`Chr1:17474146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B108,C18
`Chr1:17474165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,A24,B128,B138,B64
`Chr1:17474186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:17474196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C37
`Chr1:17474220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B40,D4
`Chr1:17474244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B48,B56,B61,C53
`Chr1:17474261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A15,B106,B119,B120,B122,B132,B38,B4,B60,B67,C53
`Chr1:17474280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D3
`Chr1:17474721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769458.1

141 aa

141

DUF4371

PF14291 DUF4371 1-63 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769458.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	1	63	8.1e-28	98.3	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913475.1
ATGGGGGTAGTTTTAAGATATGTGAATGATAAAGGATGTGTAATTGAAAGATTTATTGGCATTGTGCATGTTGTTGACACTTGTTCACATTCTCTTAAAGATGCTCTTAGTGCTTTATTTGTGAAACATGGTTTATCACTATCAAAACTGAGGGGTCAAGGATATGATGGAACTTCAAATATGAGAGCTACTGCTTCTGTTGAAAGAGCATTTTCTGCAATGAAGCTAGTCAAAAGTGATTTGCGAAATCGTATGCAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989445
ATGGGGGTAGTTTTAAGATATGTGAATGATAAAGGATGTGTAATTGAAAGATTTATTGGCATTGTGCATGTTGTTGACACTTGTTCACATTCTCTTAAAGATGCTCTTAGTGCTTTATTTGTGAAACATGGTTTATCACTATCAAAACTGAGGGGTCAAGGATATGATGGAACTTCAAATATGAGAGCTACTGCTTCTGTTGAAAGAGCATTTTCTGCAATGAAGCTAGTCAAAAGTGATTTGCGAAATCGTATGCAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769458.1
MGVVLRYVNDKGCVIERFIGIVHVVDTCSHSLKDALSALFVKHGLSLSKLRGQGYDGTSNMRATASVERAFSAMKLVKSDLRNRMQDEWMNDSLIVYIENDIFSTIDNEKILQRFQSMSTRRNQLSSLSQTETTTSPSIYS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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