当前解析结果
SmilChr01G000812| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000812 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000812 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000812 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 17538360 - 17540129 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130989690 |
|---|---|
| GeneID | 130989690 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989690 |
| 原始查询 | SmilChr01G000812 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989690 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057769766.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057769766.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057769766.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057769766.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057769766.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:17539274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B23,D10 |
Chr1:17539274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B23,D10 |
Chr1:17539280 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr1:17539282 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C16 |
Chr1:17539286 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 37 | A1,A11,A24,A4,A8,A9,B106,B107,B123,B125,B133,B21,B25,B3,B36,B37,B49,B50,B53,B61,B74,B85,B86,B88,B90,B91,C20,C35,C4,C43,C45,C47,C57,C61,C71,C85,D6 |
Chr1:17539288 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B43,C27 |
Chr1:17539293 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:17539302 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B59,C76 |
Chr1:17539302 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B59,C76 |
Chr1:17539306 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B111,B131,B53,C57,C66 |
Chr1:17539307 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B23,B43,C27 |
Chr1:17539317 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 18 | B110,B114,B13,B14,B28,B29,B42,B60,B84,B86,C35,C37,C50,C53,C64,C81,C83,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。