当前解析结果
SmilChr01G000814| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000814 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000814 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000814 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 17594313 - 17595197 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130989761 |
|---|---|
| GeneID | 130989761 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989761 |
| 原始查询 | SmilChr01G000814 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989761 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057769875.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057769875.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.60000 | XP_057769875.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057769875.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057769875.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:17594321 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B37,B69,D6 |
Chr1:17594321 |
TTC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B37,B69,D6 |
Chr1:17594328 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:17594329 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B37,B69 |
Chr1:17594480 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 29 | A10,A22,A3,A4,A7,B109,B119,B19,B23,B33,B41,B47,B49,B57,B69,B81,B95,B96,C12,C14,C17,C29,C41,C46,C54,C61,C62,C74,D3 |
Chr1:17594489 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B33,B49 |
Chr1:17594489 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B33,B49 |
Chr1:17594490 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:17594495 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B33,B49 |
Chr1:17594507 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D11 |
Chr1:17594507 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:17594509 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。