当前解析结果
SmilChr01G000815| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000815 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000815 |
| 描述 | vegetative cell wall protein gp1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 17598615 - 17599142 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130989844 |
|---|---|
| GeneID | 130989844 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989844 |
| 原始查询 | SmilChr01G000815 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | vegetative cell wall protein gp1-like |
| 产物 | vegetative cell wall protein gp1-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989844 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057769997.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057769997.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057769997.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057769997.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057769997.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:17598632 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B56,C1,C38,C52 |
Chr1:17598637 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,C66 |
Chr1:17598652 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,B90 |
Chr1:17598674 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D11 |
Chr1:17598674 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:17598680 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:17598709 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B14,C71 |
Chr1:17598714 |
A |
ATT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B14,C71 |
Chr1:17598714 |
A |
ATT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B14,C71 |
Chr1:17598716 |
TTG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B14,C71 |
Chr1:17598716 |
TTG |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B14,C71 |
Chr1:17598780 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B9,C31,C74 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。