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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000822`

染色体: Chr01 坐标: 17751353-17758891 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000822`
名称	SmilChr01G000822
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17751353 - 17758891 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006817`
GeneID	`131006817`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006817`
原始查询	`SmilChr01G000822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24-like
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24-like
Arabidopsis	`AT4G30890` (UBP24) ubiquitin-specific protease 24 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829213] identity=65.3; qcov=0.675; evalue=1.71e-171; confidence=high
Rice	`Os07g0661300` - identity=60.8; qcov=0.71; evalue=6.46e-162; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00443 (UCH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006817

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789953.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789953.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057789953.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789953.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17752958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B78,C39,D7
`Chr1:17756614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B50
`Chr1:17756640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789953.1

542 aa

271

542

UCH

PF00443 UCH 185-539 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789953.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	185	539	3.4e-45	155.4	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933970.1
TTGTTTTCCTTTTCCTAATTTCTACTCCCACTTTCTCTCTCACACATTTCACCCTTTTTCCCCACAGGGCTTTTGCGCTCGGCGCTCTCTTTCTTCCCCTCTCTCTGTCTTAAATTTTAATGTCTTCTGCTGTGTCCTCGCTTTCTCTGTCTTCCGACATCGTTTCGAGCAGACGGCATTGTTTCATCCTAGATGCCCAACCGTTGTGCTCTTCCATGAGGTCCTCGATGCTCCCATTCTCAACATGACTGATAATCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006817
ATGACTGATAATCAGGTGTTGGTTTTTGGATCTTTTACTGAAGATGAGATCAGATCCATGCAATGTCAACCACAAAAGAATGATACACAGATAATATTTGGTTCTTTGGATTTGGAAACTTTAAGATCTGTGGGAATTTTCAGTACAAAATTGACTGAGCTTCATTCACCTAATGGATCTGAGAGTTCAATACCTGATAATACACCAAATAAAATGCTCCCTTGTGATAGCAGAAGTACACCAGTCTCAGAAGTTGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789953.1
MTDNQVLVFGSFTEDEIRSMQCQPQKNDTQIIFGSLDLETLRSVGIFSTKLTELHSPNGSESSIPDNTPNKMLPCDSRSTPVSEVAVVEENGCPNRTICPGDSGLKQLKPAKIDGHASVGSDSAHNLSKKSTTELPDINGVRELFYSENIVLHDSGNGIQQVDSVWSTYKDSNWPNPIRRSFLPRGLVNLGNLCFLNATLQALLSCSPFLELLHELRNSNIPEIGYPTLRAFVDFISDFDMLPDSVEKRNENTALQTGIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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