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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000824`

染色体: Chr01 坐标: 17774833-17778757 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000824`
名称	SmilChr01G000824
描述	uncharacterized SmilChr01G000824
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17774833 - 17778757 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006818`
GeneID	`131006818`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006818`
原始查询	`SmilChr01G000824`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	THUMP domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831116]; symbol=AT5G12410; hit=AT5G12410; species=arabidopsis; confidence=high
产物	THUMP domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831116]; symbol=AT5G12410; hit=AT5G12410; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G12410` (AT5G12410) THUMP domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831116] identity=52.6; qcov=1.01; evalue=5.61e-126; confidence=high
Rice	`Os11g0568600` - identity=47.9; qcov=0.989; evalue=3.36e-115; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0006400 (tRNA modification)
KEGG	-
Pfam	PF02926 (THUMP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006818

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789954.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057789954.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789954.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789954.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17775087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C87,D11,D9
`Chr1:17775973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B78,C39,D7
`Chr1:17776012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:17776076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr1:17776219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:17776292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B52
`Chr1:17776684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,B75
`Chr1:17776785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C87,D11,D9
`Chr1:17776895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:17776897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:17776899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr1:17777050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789954.1

380 aa

190

380

THUMP

PF02926 THUMP 277-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789954.1`	Pfam	`PF02926`	THUMP	Domain	277	359	1e-14	55.4	THUMP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933971.1
ACACATAGCAATGTAAAAGCGTAGACAAATGAAAACCAGTTTTACTGAAAGGCCCATTGGGCTTTTAGCGACGTGACATTAATCAACCAAAATCGAAAGCAGAAATGGCGGCACTATAAACCTCGCATTTCTCGGCACGCTTCGCCTGCAGTAACTTAATGGCGACCGACGACAACTCCAATCCAACCAACTCCAACAAGAAGAGAAAGAATTACCTTCCCCAATATAGGCCAGTGAAAAAGGGCGCTTACCCATTACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006818
ATGGCGACCGACGACAACTCCAATCCAACCAACTCCAACAAGAAGAGAAAGAATTACCTTCCCCAATATAGGCCAGTGAAAAAGGGCGCTTACCCATTACGTGCGGGAGTTGAGGGATTCTTCATAACGTGTGATGGTGGGAGGGAGCACCAGGCAGCAAATGAAGCTATCAGTGTCATTGAATCTTTCTATGAAGAACTGGTGGATGATGCAGAGTCAAAGTTTGAGCACGCAGAACCACCGAAGAAGCCTTCAAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789954.1
MATDDNSNPTNSNKKRKNYLPQYRPVKKGAYPLRAGVEGFFITCDGGREHQAANEAISVIESFYEELVDDAESKFEHAEPPKKPSNKITKFASDSSGSDNDDDDDDKDSNKDDAKDKNNLETREDKNQSAVASTDNGNDESRLETENAVPPQNQTPTEEEKPEHRDTKEAETLGPQAKRQCTDADAANSGSLPKKVETKSVDKLIEAELAELGDKSKRRFCKLDTGCNGVVFIQMRKKEGDPSPKDIVHHMMTSLAVTKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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