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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000828`

染色体: Chr01 坐标: 17832794-17833947 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000828`
名称	SmilChr01G000828
描述	uncharacterized SmilChr01G000828
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17832794 - 17833947 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990617`
GeneID	`130990617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990617`
原始查询	`SmilChr01G000828`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	far-red elongated hypocotyls 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821781]; symbol=FHY3; hit=AT3G22170; species=arabidopsis; confidence=low
产物	far-red elongated hypocotyls 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821781]; symbol=FHY3; hit=AT3G22170; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G22170` (FHY3) far-red elongated hypocotyls 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821781] identity=27.5; qcov=0.449; evalue=9.42e-12; confidence=low
Rice	`Os03g0843700` (OSJNBa0032G11.9) - identity=29.9; qcov=0.401; evalue=1.79e-11; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770836.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770836.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770836.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770836.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770836.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17832800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:17832808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:17832856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B78,C39
`Chr1:17832863`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A10,A22,A23,A3,A4,A7,B105,B109,B119,B131,B26,B3,B41,B47,B50,B67,B69,B78,B81,B95,C12,C14,C17,C24,C29,C3,C34,C39,C41,C46,C62,C86,D8,D9
`Chr1:17832882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:17832890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B78,C39,D7
`Chr1:17832948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:17832959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:17833020`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B107,B114,B122,B129,B13,B14,B44,B55,B58,C51,C71,C74,D10
`Chr1:17833044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:17833046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:17833051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914853.1
ATGAATGTTGCAGAGAAATTGCCTTCAAATTTGAGGGAGGATTCTGATTTCAAGGTTAGTTTCGATAAGATTGTATGGTCTGATACTGCTGAGCCTCATGAGTTTGAGGATAACTGGAGTAATTTGATAGATGAATATGGGTTGGCTGACAACAGATGGTTCTCTGACATGTACGAGGATCGATCGTTCTGGATTCCTGTTTATTTTCGTGACATCAATATGAGTGGGTTTTTTCGCACCCCTTTATTGTCGGATAGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990617
ATGAATGTTGCAGAGAAATTGCCTTCAAATTTGAGGGAGGATTCTGATTTCAAGGTTAGTTTCGATAAGATTGTATGGTCTGATACTGCTGAGCCTCATGAGTTTGAGGATAACTGGAGTAATTTGATAGATGAATATGGGTTGGCTGACAACAGATGGTTCTCTGACATGTACGAGGATCGATCGTTCTGGATTCCTGTTTATTTTCGTGACATCAATATGAGTGGGTTTTTTCGCACCCCTTTATTGTCGGATAGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770836.1
MNVAEKLPSNLREDSDFKVSFDKIVWSDTAEPHEFEDNWSNLIDEYGLADNRWFSDMYEDRSFWIPVYFRDINMSGFFRTPLLSDSENSYFKRFLNKFSDLVILFMNYNSALNSQQDTCQKLNFADETVVNLFIRKGLLCRHMYYILRWLKVNKIPERYIANQWCKSYMLSTPQVFSKCIGHVSGDQDLTKQLLATFIEVENKFGKLGNKNPTANSKDLIFKEFYGSVPPEVPTVLPPAVAKTKGSGAGGRRKSNKKKAM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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